科研产出
安徽六安地区1例鹅圆环病毒病PCR诊断与分析
《安徽农业科学 》 2023
摘要：[目的]对安徽六安某朗德鹅场送检的疑似圆环病毒病的病料进行鉴定.[方法]采集病例中鹅的肝脏,提取病毒DNA,根据Gen-bank已登录GoCV基因序列设计引物,通过PCR检测病料中GoCV,对扩增到的序列进行测序,最后将获得的序列构建进化树进行遗传进化分析.[结果]检测到大小为580 bp的目的条带,序列比对结果发现,鉴定株与山东分离株KT387277.1 的遗传距离最近.[结论]该研究结果为了解该地区GoCV的流行情况提供了参考.
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土壤中烟草根黑腐病菌的real-time PCR分子检测
《中国烟草学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：根据烟草根黑腐菌与其它近缘真菌在ITS序列上的差异,设计PCR检测引物TbF/TbR,并通过对各菌株基因组DNA扩增验证其特异性;以接种10倍浓度梯度的根黑腐菌孢子的土壤DNA为模板,建立土壤烟草根黑腐菌real-time PCR检测的标准曲线,得出每个反应体系中分生孢子数目的对数(x)和对应的Ct值(y)之间呈线性关系:y=-1.5373x+24.955,R2=0.9909(P<0.01).通过对5块烟田土壤烟草根黑腐菌检测和烟田烟草根黑腐病的调查,证实上述方法可以准确检测土壤中烟草根黑腐菌孢子数量.
关键词： 烟草根黑腐病 rDNA-ITS real-time PCR
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绵羊肺炎支原体安徽株p113基因PCR检测与序列分析
《畜牧与饲料科学 》 2019
摘要：旨在应用基于p113基因特异性的PCR方法对绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae,Mo)安徽流行株进行分子生物学鉴定。利用已报道的Mo p113基因引物,采用PCR方法对前期分离的Mo安徽流行株AH-01、AH-02、AH-03和AH-04进行p113基因扩增,并对菌株的p113基因扩增产物进行序列测定及分析。结果表明,利用建立的PCR方法,4株Mo临床分离株均可扩增到大小约为287 bp的特异性目的片段;安徽流行株AH01、AH02、AH03和AH04的p113基因序列两两之间的相似性均在95%以上,与Mo ATCC 29419和Mo贵州流行株GZ-QX1的p113基因序列相似性在88.6%～89.3%。提示基于p113基因的PCR方法可以用于绵羊肺炎支原体的分子生物学鉴定,为开展由Mo引起的绵羊和山羊肺炎的流行病学调查和科学防控提供了新方法。
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雏鸡感染鸡白痢沙门菌后禽β-防御素6和鸡Toll样受体15在肠道转录与定位研究
《畜牧兽医学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：旨在分析雏鸡感染鸡白痢沙门菌后,禽β-防御素6(AvBD6)和鸡Toll样受体15(ChTLR15)在小肠内的分布及表达规律。本研究用鸡白痢沙门菌感染14日龄的雏鸡,感染后不同时间点采取雏鸡的小肠组织(十二指肠、空肠和回肠),利用实时荧光定量RT-PCR和原位杂交方法,检测AvBD6和ChTLR15在小肠组织内的定位和mRNA的转录水平变化。结果显示,雏鸡感染鸡白痢沙门菌后,AvBD6和ChTLR15在各肠段组织中均有转录,其中在十二指肠相对转录量最高,在0~24h内呈上升趋势,24~48h相对转录量呈下降趋势,在24h的转录量极显著高于0和6h(P<0.01),且AvBD6在24h的转录量显著高于12h(P<0.05)。AvBD6和ChTLR15mRNA在小肠内均有不同程度的分布,其主要分布在肠绒毛的中央乳糜管中,在十二指肠中荧光信号最强。结果表明,雏鸡感染鸡白痢沙门菌后,AvBD6和ChTLR15mRNA在鸡小肠中的分布和表达具有一定的规律性,并参与肠道免疫调节功能。
关键词： 鸡白痢沙门菌 荧光定量RT-PCR 原位杂交 禽β-防御素6 鸡Toll样受体15
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猪流行性腹泻病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
《养猪 》 2014
摘要：根据Gen Bank登录的猪流行性腹泻病毒(PEDV)毒株(登录号KJ960180)的M基因保守序列,设计1对扩增片段大小为299 bp的特异性引物,经PCR扩增、克隆、测序鉴定后,提取质粒作为阳性标准品,建立了PEDV的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR检测方法。该方法在1.21×103~1.21×108拷贝/μL范围内呈现良好的线性,相关系数(R2)为0.999,扩增效率为99%,扩增产物的熔解曲线为单个特异峰,产物Tm值为85.5~86℃,最低检测限为1.21×101拷贝/μL。本研究建立的SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR检测方法特异性强、重复性好、成本低且操作简单,适用于PEDV的早期诊断、定量研究和流行病学监测。
关键词： 猪流行性腹泻病毒 SYBR GreenⅠ 荧光定量RT-PCR
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家蚕G蛋白a亚基基因BmGa73B原核表达及其表达条件优化
《中国蚕业 》 2012
摘要：通过RT.PCR技术从家蚕中扩增出G蛋白a亚基基因BmGa73B的cDNA,克隆至原核表达载体pET41b(+)中,所获得的重组质粒经酶切鉴定后,将其转化至EcoliBL21诱导表达,用SDS.PAGE与Westernblot对表达产物进行鉴定.结果表明,通过RT-PCR扩增获得长度为1158bp的蛋白基因,诱导表达重组质粒pET41b(+)-Ga73B,经SDS-PAGE检测,IPTGr的终浓度为1mmol/L时,诱导dh时蛋白表达量最高,出现分子质量约为73kD的目的蛋白带,与蛋白的理论值相符.经Westernblot检测,表达产物可与GST发生特异性反应.
关键词： G蛋白0a亚基 BmGa73B RT-PCR 克隆 原核表达
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家蚕G蛋白α亚基基因BmGα73B原核表达及其表达条件优化
《中国蚕业 》 2012
摘要：通过RT-PCR技术从家蚕中扩增出G蛋白α亚基基因BmGα73B的cDNA,克隆至原核表达载体pET-41b(+)中,所获得的重组质粒经酶切鉴定后,将其转化至E coli BL21诱导表达,用SDS-PAGE与Western blot对表达产物进行鉴定。结果表明,通过RT-PCR扩增获得长度为1 158 bp的蛋白基因,诱导表达重组质粒pET-41b(+)-Gα73B,经SDS-PAGE检测,IPTGr的终浓度为1 mmol/L时,诱导4 h时蛋白表达量最高,出现分子质量约为73 kD的目的蛋白带,与蛋白的理论值相符。经Western blot检测,表达产物可与GST发生特异性反应。
关键词： G蛋白α亚基 BmGα73B RT-PCR 克隆 原核表达
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利用Real-time RT-PCR法检测抗病毒活性物质对CMV复制的影响
《烟草科技 》 2011 北大核心
摘要：为准确检测经活性物质处理后的烟草体内病毒含量,建立了real-time RT-PCR检测体系。从烟田中分离到1株对CMV有拮抗作用的细菌B6,经分离纯化得到拮抗CMV的活性物质B6p,其分子量为40.6 kDa。利用叶圆片法,分析了活性物质处理后寄主体内病毒的复制特点,结果表明寄主体内的病毒复制作用受到了拮抗活性物质的抑制,并且随着拮抗活性物质浓度的增加病毒的复制作用减弱。
关键词： real-time RT-PCR 病毒 活性物质 CMV
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水稻根系不同强度干旱胁迫下5个基因表达分析
《华北农学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：通过不同浓度的PEG处理,模拟不同强度的干旱胁迫,研究水稻幼苗根系中5个基因的表达情况,结果表明:不同强度干旱胁迫下,根系中各基因表达也各不相同,但是在轻度干旱和中等干旱胁迫下,主要以下调为主,少数表达上调,严重干旱胁迫下情况比较复杂,有基因以上调为主的(抗坏血酸过氧化物酶4基因、核内小RNAZ274基因、甲酸四氢叶酸连接酶基因),也有基因以下调为主的(木聚糖酶抑制子蛋白1前体基因),还有基因以上调为主,但是上调倍数不大,下调倍数很大(酸性内切几丁质酶基因);5个基因表达的日变化表现出6种类型,每种类型的日表达都是上下波动的;抗旱品种的水稻根系对不同强度的干旱可能采取不同的应对策略,对轻度干旱和中等干旱可能是减少不必要的能量和物质消耗,过度干旱、严重干旱胁迫下才调动大量抗逆相关物质,抵抗干旱的伤害。
关键词： Real-time PCR 干旱胁迫 基因表达变化 根系
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砀山酥梨果实苯丙氨酸解氨酶基因cDNA克隆及序列分析
《激光生物学报 》 2010 CSCD
摘要：为了研究梨石细胞形成与木质素合成的关系,以砀山酥梨果实为材料,通过基于同源性的RT-PCR方法,克隆木质索合成途径中的关键酶苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因。同时利用基因数据库资料对克隆的PAL,序列进行比较分析。结果表明,从砀山酥梨果实中克隆的PAL基因cDNA片段长度为585 bp,推断其编码195个氨基酸序列。该序列包含与其它植物PAL相同的活性催化位点,经序列分析和同源性比对,该氨基酸序列与其它植物PAl氨基酸序列的同源性在90%以上。系统进化树分析表明,砀山酥梨PAL氨基酸序列与蔷薇科的甜樱桃PAL氨基酸序列聚类关系最近。
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