科研产出
黟县黑猪微卫星遗传多样性分析
《上海农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：选择55头黟县黑猪的血液样品,采用PCR(聚合酶链式反应)和PAGE(聚丙烯酰胺凝胶电泳)法对14个微卫星标记进行分型,分析黟县黑猪群体的遗传多样性。结果表明:在黟县黑猪群体中,14个微卫星位点共检测出171个等位基因,平均每个位点约12个,有效等位基因数为3.11—12.37,观测杂合度范围为0.31—1;14个微卫星位点多态性含量为0.65—0.91,均具有高度多态性,累积排除概率达99.9%,说明选择的14个微卫星标记能够对黟县黑猪的亲缘关系进行鉴定。
关键词： 黟县黑猪 微卫星标记 遗传多样性 聚丙烯酰胺凝胶电泳
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安徽新安江水牛mtDNA D-Loop区遗传多样性与系统进化研究
《中国草食动物科学 》 2024
摘要：试验旨在分析安徽省黄山市新安江流域上游地区新安江水牛群体的分子遗传特性,探究其母系起源与遗传多样性.利用PCR扩增和测序技术测定28头新安江水牛的mtDNA D-Loop序列,下载GenBank数据库中24个中国水牛群体的693条D-Loop序列,利用生物信息学分析其遗传多样性,构建Neighbor-joining系统发生树和Media-joining网络,探索不同水牛群体的遗传距离.结果显示,28头新安江水牛的mtDNA D-Loop序列共有117个变异位点,构成25种单倍型,其核苷酸多样性为0.026 02±0.003 03,单倍型多样性为0.989±0.014.新安江水牛群体的变异性水平与中国其他水牛群体接近.N-J系统进化树显示,新安江水牛25个单倍型分为A、B两个支系,具有A支系和B支系2个母系来源,其中A支系占据主导地位.Media-joining进化网络显示,中国水牛主要为沼泽型水牛,分为沼泽型水牛A支系和B支系,B支系又分为b1亚支系和b2亚支系.综上,新安江水牛群体变异水平与中国其他地方水牛群体接近,群体遗传多样性丰富;且新安江水牛属于沼泽型水牛,具有2个线粒体母系来源,与我国其他地方水牛群体具有一定的遗传距离.
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中华鳖养殖过程中浮游生物群落结构的演变
《中国农学通报 》 2024 CSCD
摘要：为研究中华鳖养殖过程中,池塘浮游生物群落结构的演变.在放养前、养殖中期和养殖后期3个阶段采集水样,进行理化、浮游生物检测与分析.结果表明:养殖后期NH4+-N达2.38 mg/L,显著性高于养殖前和养殖中期.共检出浮游植物5 门 62种,种类组成以绿藻门、蓝藻门为主;浮游动物4类39种,以原生动物、轮虫为主.浮游植物生物丰度和生物量以绿藻为主,浮游动物以桡足类为主.养殖中期浮游植物、浮游动物平均丰度达到最高值,分别为4762600、1634 ind/L;养殖后期浮游植物、浮游动物生物量达到最高,分别为18.09、10.106 mg/L.养殖中期的浮游植物多样性指数(H)和均匀度指数(J)平均值分别为0.1779、0.0604,显著性低于养殖前;养殖中后期,纤维新月藻为绝对优势藻;中华鳖养殖前后浮游动物多样性指数(H)差异不显著.研究表明,中华鳖养殖过程中,池塘浮游植物群落结构变化较大,而浮游动物变化较小;养殖水体表现出先变差再逐渐变好的趋势,养殖中期水体稳定性差,需要进行积极调水.
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安徽花亭湖浮游生物调查及水质分析
《安徽农业科学 》 2024
摘要：2022年7月和10月分别调查了安徽花亭湖的浮游生物状况，并利用Shannon-Wiener多样性指数、Pielous均匀度指数和Margalef丰富度指数对其水质进行评价，研究花亭湖现阶段浮游生物群落组成和多样性状态。结果表明，共鉴定出浮游植物6门35属51种（包括变种和变型）,其中蓝藻门最多（47.06%）,其次是绿藻门（27.45%）和硅藻门（11.77%）。浮游植物的平均密度和生物量分别为9.57×10~6 cell/L、5.24 mg/L。浮游植物的优势种共6种，分别为蓝藻门的放射微囊藻（Microcystisbotrys）、挪氏微囊藻（Microcystis novacekii）、多变鱼腥藻（Anabaena variabilis）、崎岖鱼腥藻（Anabaena inaequalis）和硅藻门的颗粒直链藻（Melosira granulata）、颗粒直链藻极狭变种螺旋变型（Melosira granulata var.angustissima f.spiralis）,其优势度分别为0.476、0.043、0.035、0.023、0.054和0.071。浮游植物的Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数季节差异不明显，而Margalef丰富度指数夏季大于秋季。此次调查共鉴定出浮游动物3门15科15属23种，包括节肢动物6种、轮虫11种、原生动物5种。浮游动物的平均密度和生物量分别为398.44个/L和4.33 mg/L。浮游动物的优势类群共3种，分别为轮虫纲的螺形龟甲轮虫（Keratella cochlearis）和节肢动物门的透明温剑水蚤（Thermocyclops hyalinus）、无节幼体（Nauplius）,其优势度分别为0.256、0.042和0.223。浮游动物的Shannon-Wiener多样性指数、Pielou均匀度指数和Margalef丰富度指数均是夏季大于秋季。综合判断花亭湖水体为中营养偏清洁型。
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基于55K SNP芯片揭示小麦育种亲本遗传多样性
《作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了解不同省份小麦亲本材料间的遗传多样性,以150份分布于安徽、江苏、河南、四川及山东等省份小麦种质资源为试验材料,利用小麦55K SNP芯片对其进行遗传多样性分析、聚类分析、主成分分析及群体结构分析。结果表明,在150份小麦材料中共检测到52,537个SNP位点,质控后共获得39,422个有效标记,其中多态性标记为38,135个,占有效标记数96.74%。多态性标记在亚基因组间分布呈现D （10,450）＜A （12,365）＜B （15,290）;平均多态信息含量（PIC）为0.315,变幅为0.068～0.375。各省供试材料平均遗传距离呈现:河南省＞四川省＞山东省＞江苏省＞安徽省;聚类分析、主成分分析和群体结构分析结果高度一致,分群结果与血缘关系、区域来源及育成单位均较为吻合。本研究表明各省份平均多态性信息含量处于中度多态水平,但材料平均遗传距离较为接近,仍需引入优质种质资源,缓解材料同质化情况,增加小麦应对逆境胁迫能力,减轻小麦实际生产中的脆弱性及风险性。
关键词： 小麦 55K SNP芯片 育种亲本 遗传多样性 群体结构分析
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安徽地区主栽粳(糯)稻品种遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
《生物学杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：以安徽省近年来主栽的21份粳（糯）稻品种为材料，采用国家标准NY/T 1433—2014中推荐的48对SSR引物进行多态性分析，研究品种间的遗传多样性。48对引物中21个SSR标记在21份材料中存在多态性，共检测到59个等位基因，平均每个标记检测到2.81个。遗传多样性分析显示：Shannon’s多样性指数变幅为0.199～1.163,平均值为0.657;Nei’s指数变幅为0.095～0.620,平均值为0.390。多态信息含量（PIC）处于0.091～0.549,平均值为0.331。21个品种间存在一定遗传差异，但等位基因观测数、Shannon’s指数、Nei’s指数均较低，表明21个品种间遗传背景较为狭窄。UPGMA聚类分析表明：21个粳（糯）稻品种的遗传相似系数为0.426～0.954,遗传相似系数在0.62处可将21个品种分为5个类群。根据标记的PIC值和MI值进一步简化标记的使用量，利用7个核心SSR标记构建了21份粳（糯）稻材料的标准指纹图谱，为品种真实性判别、纯度鉴定以及核心种质提纯奠定基础。
关键词： 粳(糯)稻 遗传多样性 SSR标记 DNA指纹图谱
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化学防治对皖南烟区蜘蛛群落多样性的影响
《植物保护 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为探究化学防治对皖南烟区烟叶上蜘蛛群落多样性的影响，于2021年4月至7月采用目测法和拍打振落法对未进行化学防治田（抑芽剂）和化学防治田（抑芽剂和化学农药）烟叶上的蜘蛛进行了调查。共记录鉴定未化学防治田蜘蛛（12科40种943头）和化学防治田蜘蛛（11科32种693头）的数量为1 636头，分属于13科44种。蜘蛛的卵囊附着在烟叶的叶尖和叶缘，6月下旬达到峰值。烟田蜘蛛群落的时间动态和多样性指数变化说明，未化学防治田和化学防治田蜘蛛的个体数量均在5月中旬达到最大，但丰富度呈现一定的波动，多样性指数和均匀度指数在6月底到7月初达到最大，但优势集中性指数在这期间最小。两种类型的烟田中草间钻头蛛Hylyphantes graminicola和食虫沟瘤蛛Ummeliata insecticeps均为优势种。通过对两烟田蜘蛛群落多样性的比较，结果表明，未化学防治田比化学防治田的蜘蛛群落更具有稳定性，且化学防治对烟田蜘蛛的个体数量影响显著。本文对了解烟田蜘蛛群落生态系统以及烟田的绿色防控奠定理论基础。
关键词： 化学防治 蜘蛛群落组成 时间动态 多样性 皖南烟区
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安徽省翘嘴鲌野生群体的遗传多样性分析
《生物学杂志 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为探讨安徽省翘嘴鲌(Culter alburnus)野生群体的遗传多样性及亲缘关系,利用10对微卫星标记分析4个翘嘴鲌采样群体(巢湖、武昌湖、新安江和淮河干流)的遗传多样性与遗传结构.结果显示:4个群体的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、预期杂合度(He)、多态信息含量(PIC)分别为10.4~12.2、5.9~6.9、0.654~0.800、0.739~0.778和0.689~0.738,均显示高度的遗传多样性;分子方差分析(AMOVA)群体内遗传变异占比95.71%,远高于群体间的4.29%;总群体遗传分化系数(Fst)仅为0.043,成对群体间Fst为0.025~0.056,表现为低度分化;群体间基因流值(Nm)为4.21~9.75,表明群体间基因交流频繁;基于群体间遗传距离构建系统进化树显示,新安江群体与巢湖群体亲缘关系最近,与淮河群体最远.使用软件Structure 2.3.4遗传聚类分析结果显示其最佳聚类分组为4,但与各采样群体不相对应,群体间遗传相似个体交叉较多.研究表明:翘嘴鲌4个采样群体的遗传多样性高、遗传分化不显著,群体间可能存在种质混杂.
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农村生活污水贝类净化区细菌群落结构解析
《安徽农业科学 》 2022
摘要：[目的]研究农村生活污水贝类净化区的细菌群落结构.[方法]采用Illumina-MiSeq高通量测序技术对贝类处理单元水体及贝类样品进行细菌多样性分析.[结果]贝类样品中的细菌群落多样性和丰度均显著高于处理单元水体.4组样品中均有大量序列不能被归入已知的属,在门的分类水平上,优势菌门是蓝细菌门(Cyanobacteria)和放线菌门(Actinobacteriota);在属水平上,优势细菌属主要为Cyanobium_PCC_6307、hgc I_clade.菌群分析发现贝类处理单元水体可能处于富营养化进程中.水质检测分析发现贝类通过滤食作用对氨氮、总磷和COD的去除率分别达到39.75%、37.21%、59.52%.[结论]该研究为贝类净水技术提供基础数据,对贝类处理农村生活污水系统的构建具有指导意义.
关键词： 农村生活污水 淡水贝类 净化区 高通量测序 群落结构 细菌多样性
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