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资源类型: 中文期刊
关键词:RAPD(模糊匹配)
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基于RAPD标记的丽江云杉遗传多样性及谱系地理

植物研究 2011 北大核心 CSCD

摘要:由于青藏高于独特的地理环境,第四纪冰期反复的退缩和扩展对目前该地区生物物种的地理分布及居群结构产生重要的影响。本文对这一地区特有分布物种丽江云杉(Picea likiangnsis)3个变种丽江云杉变种(var.liki-angensis)、川西云杉变种(var.rubescens)和林芝云杉变种(var.linzhiensis)共11个种群228个个体进行RAPD分析,研究其遗传多样性及谱系地理。结果表明,该种具有较高的总体遗传多样性,多态位点达85.42%;然而在群体水平上却保持了相对低的多态性,种群间差异不显著,种群平均多态条带百分率为62.31%,Nei's平均遗传多样性指数(HE)为0.250,Shannon's多样性指数(Hpop)从0.267到0.421 1。Nei's基因多样性(GST=0.256)和AMOVE分析(Phist=0.236)表明,群体间有较高的遗传分化,群体间基因流有限(Nm=1.453 2),远远低于已报道的其它松科植物。UPGMA聚类分析表明3个形态上分离的变种没有单个聚成一枝,形成单系群。本研究认为,在第四纪冰期丽江云杉这一种在南部可能存在至少3个不同的避难所,北边和西边的居群应该是南方避难所里的居群经过不同的回迁路线而产生的,有可能是由于种内亚种间的反复杂交造成了目前的种群分布模式。

关键词: 丽江云杉 遗传多样性 RAPD 谱系地理

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~(60)Co-γ射线辐射诱变蝴蝶兰M1代花型突变体的RAPD分析

激光生物学报 2011 CSCD

摘要:利用72个10bp随机引物对蝴蝶兰(F141780)及其~(60)Co-γ射线辐射的8个表现型花型突变体进行RAPD分析。其中有30个引物能扩增出理想的带型,有4个随机引物扩增出的带型显示其中的25-6、30-4、30-8-2等3个突变体与对照品种之间具有稳定的多态性差异,即初定其为基因型花型突变体。

关键词: 蝴蝶兰 花型突变体 ~(60)Co-γ射线 辐射 RAPD

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栝楼的RAPD-PCR体系建立与优化

安徽农业科学 2010 北大核心

摘要:[目的]建立栝楼的RAPD-PCR体系并对该体系进行优化。[方法]以栝楼叶片为材料,采用CTAB法提取栝楼叶片基因组DNA,利用正交设计对RAPD-PCR体系进行优化。[结果]各因素水平变化对PCR反应影响大小依次为:Mg2+、TaqDNA聚合酶、引物和dNTPs。通过试验分析,优化的栝楼RAPD反应体系为:在25μl反应体系中,含10×buffer2.5μl,Mg2+2.0mmol/L,Taq酶1U,引物0.8μmol/L,dNTPs0.1mmol/L。反应程序为94℃预变性2mim;94℃变性30s,37℃退火温度40s,72℃延伸1.5mim,36次循环;72℃延伸10mim,4℃保存。[结论]该研究建立的栝楼RAPD反应体系稳定可靠,为栝楼性别鉴定、遗传多样性分析、亲缘关系分析等方面的研究提供了有效的方法。

关键词: 栝楼 RAPD 分子标记 优化

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‘砀山酥梨’芽变‘97-05-9’的RAPD分析

中国农学通报 2010 北大核心

摘要:利用RAPD分子标记技术对37份梨种质资源进行了遗传亲缘关系及分类研究。从80个随机引物中筛选出27个引物进行扩增,应用SPSS11.0软件进行聚类分析。聚类分析结果表明:不同梨品种之间存在明显的遗传差异,‘砀山酥梨’与营养系变异‘97-05-9’具有很近的亲缘关系,归为一类。且‘砀山酥梨’与其营养系变异‘97-05-9’有14个引物扩增出18条特异性条带,变异位点较多。

关键词: 砀山酥梨 芽变 RAPD 聚类分析

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水稻种子脂肪酶与储藏特性及相关基因SCAR标记的研究

高技术通讯 2006 EI 北大核心 CSCD

摘要:通过离子束诱变皖鉴2090后代脂肪酶活性检测分析,获得了脂肪酶活性高低的近等基因系.利用人工加速老化实验进行了耐储藏性评价,并从近等基因系中选取一对脂肪酶活性不同的材料进行RAPD标记筛选,在650条随机引物中经过多次重复筛选,引物S1302、S1380在脂肪酶活性低的品种中稳定地显示特异的多态性.其中S1302被转化为SCAR标记.该标记的获得为进一步的分子标记辅助育种和图位克隆打下了坚实的基础.

关键词: 水稻 脂肪酶 RAPD SCAR

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文昌鸡的提纯选育及选择作用下基因组DNA的RAPD比较分析

中国家禽 2004 北大核心

摘要:对海南文昌鸡的提纯选育效果分别从外貌、体重、体型及基因组结构几个方面进行了分析,并与基础群进行比较。结果表明:选育第三世代公母鸡青喙青胫率分别为0和0.09%,下降了7.4%和4.57%;杂羽率分别为18.22%和8.67%,下降了53.75%和26.52%;各体尺指数及体重均与文昌鸡的地方品种标准相接近。运用RAPD技术分析其遗传多样性,第三世代群体平均相似系数为0.8103,较0世代的鸡群(0.7743)有所提高。运用RAPD分析可基本反映选育群体的遗传结构变异。

关键词: 文昌鸡 选育 RAPD 遗传相似系数

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水稻显性半矮秆突变基因的分子鉴定

分子植物育种 2004 CSCD

摘要:粳型水稻Y98149是从离子束诱变后代中获得的显性半矮秆突变体。本研究用RAPD技术对突变体和野生型进行了DNA指纹分析,经506个10bp的随机引物的扩增,获得4个多态性差异片段,可用作显性半矮秆基因的分子标记。RAPD的结果也表明半矮秆突变体与野生型之间基因组差异十分微小,为突变基因的鉴定提供了分子生物学证据。

关键词: 水稻 显性半矮秆突变体 RAPD

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水稻BT型CMSA23及其杂交组合RAPD标记的克隆及序列分析

安徽农业科学 2003 CSCD

摘要:利用生物信息学技术和方法对水稻BT型CMS不育系A2 3、保持系B2 3、恢复系R -18及F1 Ⅲ优 98之间具有明显多态性的13个RAPD标记序列进行分析。经Blastn分析 ,其中 9个标记为单拷贝序列 ,分别定位于不同的染色体上 ;并对部分标记进行了基因预测。

关键词: 水稻 生物信息学 RAPD 序列分析

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小麦叶片直接用于PCR和RAPD反应的方法

遗传 2002 北大核心 CSCD

摘要:本研究以经过碱处理的小麦叶片直接作为PCR和RAPD反应的模板 ,并应用于小麦转基因目标性状的跟踪检测、品种多态性分析等方面。该方法具有快速、简便等特点 ,尤其是在受测群体较大时 ,此种方法更显得经济有效。

关键词: 小麦 基因组DNA 分子标记 PCR RAPD

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水稻线粒体DNA中与雄性不育有关特异片段的克隆及序列分析

遗传学报 2002 SCI 北大核心 CSCD

摘要:该项研究利用RAPD技术 ,对野败型、矮败型和BT型细胞质雄性不育系、保持系 ,基因组DNA进行PCR扩增 ,分离到 6条不育系特有的扩增片段 ,并对野败型、矮败型不育系共有的片段进行了Southern分析、DNA序列分析和SCAR验证 ,该片段全长 1879bp ,包含 6个开放阅读框架和 8对重复序列。BLAST分析表明 ,该片段部分区域与Elytrigiaelongata、小麦线粒体tRNA Asp基因上游一段序列同源。并对该片段在线粒体DNA中的可能位置等进行了讨论

关键词: 水稻 细胞质雄性不育 mtDNA RAPD 序列分析 SCAR

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