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资源类型: 中文期刊
作者:李庆岗(精确检索)
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猪MMP9基因的多态性与产仔数性状的关联分析

安徽农业科学 2023

摘要:通过比较序列测定法,在MMP9基因第10内含子发现C/T突变,建立了PCR-SmaI-RFLP分型技术,并在淮猪新品系Ⅱ猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率,检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析。结果表明,在淮猪新品系Ⅱ猪群中,所有胎次产仔数呈TC>CC>TT的趋势,TC型个体的所有胎次产仔数显著高于CC型个体0.776头(P<0.05)。因此,MMP9基因在淮猪新品系Ⅱ猪群中与产仔数性状显著相关,为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记。

关键词: MMP9 产仔数 关联分析

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猪CAST基因多态性与生物信息学分析

浙江农业学报 2022 北大核心 CSCD

摘要:本研究旨在检测巴克夏猪、霍寿黑猪及其杂交F1代CAST基因多态性,并利用生物信息学分析碱基变异对mRNA二级结构以及CASTⅢ型蛋白的影响.结果表明,巴克夏猪、霍寿黑猪、巴克夏猪×霍寿黑猪都存在AA、AC和CC基因型,等位基因A的频率都高于等位基因C.该突变在3个猪群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),呈中度多态(0.25C使猪CAST基因mRNA序列的二级结构发生一定变化,并且最小自由能增大.p.Arg660Ser导致猪CASTⅢ型蛋白的部分理化性质略有改变,包括分子式、分子量、等电点、不稳定系数、总平均亲水性、正电荷(Arg和Lys)数等.p.Arg660Ser突变未改变猪CASTⅢ型蛋白的二级结构,突变前后都是无规卷曲和α-螺旋占的比例较高.p.Arg660Ser突变不位于猪CASTⅢ型蛋白的保守结构域上,但可导致催化相邻位p.663Ser磷酸化的蛋白激酶数减少.综上,c.1980A>C突变可能对猪CAST基因的转录效率和功能产生一定影响.

关键词: 猪;CAST基因;多态性;生物信息学分析

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猪ADAMTS1基因的多态性与产仔数性状的关联分析

养猪 2022

摘要:通过比较序列测定法,在ADAMTS1基因第7外显子发现C/G突变,建立了PCR-PvuⅡ-RFLP分型技术,并在淮猪新品系Ⅱ猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率,检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析。结果表明,在淮猪新品系Ⅱ猪群中,所有胎次产仔数呈现AB>BB>AA的趋势,AB型个体的所有胎次产仔数显著高于BB型个体0.665头(P<0.05)。因此,ADAMTS1基因在淮猪新品系Ⅱ猪群中与产仔数性状显著相关,可能为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记。

关键词: ADAMTS1 产仔数 关联分析

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不同浓度猪场沼液对甜高粱产量及重金属沉积的影响

安徽农业科学 2021

摘要:为研究不同猪场沼液浓度对甜高粱鲜草产量、水分、pH及重金属沉积的影响,试验分6组,分别用含沼液0(全水)、20%、40%、60%、80%、100%的溶液对甜高粱进行浇灌,每4 d浇灌1次,连续浇灌12次后,当株高3.5 m左右时进行甜高粱收割测产,并分析甜高粱全株鲜草的水分含量、pH、重金属含量.结果表明,自播种至收割生长期75 d,浇灌量为5994 t/hm2;甜高粱鲜草产量最高的是100%沼液组,为106.54 t/hm2,极显著高于其他组(P<0.01),且产量随着沼液浓度的增加而增加;各组间鲜草水分含量和pH差异均不显著(P>0.05);沼液浇灌增加了甜高粱鲜草中汞的含量,但未增加铅、铬、镉和砷的含量,5种重金属(铅、汞、铬、镉、砷)在鲜草中的沉积量均低于国家标准限量值.因此,猪场沼液可作为甜高粱牧草的液体肥料进行浇灌,试验用沼液的浇灌量应控制在6000 t/hm2左右,甜高粱生长至株高3.5 m时的产量为102.0~106.5 t/hm2,其重金属沉积均低于国标限量值,可作为畜禽饲养的青绿饲料,为甜高粱吸纳沼液能力及鲜草用于青绿饲料的重金属安全性研究提供基础数据.

关键词: 猪;沼液;甜高粱;牧草;重金属

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猪IGFBP3基因生物信息学分析

安徽科技学院学报 2021

摘要:目的:对猪胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBP3)基因的结构与功能进行生物信息学分析。方法:用分子生物学软件分析猪IGFBP3基因序列和IGFBP3蛋白的理化性质、二级结构、结构域、信号肽、跨膜结构、磷酸化和糖基化位点,以及不同动物IGFBP3氨基酸序列的同源性和遗传进化。结果:猪IGFBP3基因编码区长882个碱基对(bp),编码293个氨基酸。猪IGFBP3蛋白分子式为C1 359H2 182N418O411S24,相对分子质量为31 722.27,理论等电点为8.97,不稳定系数为48.17,脂肪系数为61.06,平均亲水系数为-0.592。IGFBP3蛋白存在1个长27个氨基酸残基的信号肽,但无跨膜结构,二级结构以无规卷曲(65.87%)和α螺旋(20.82%)为主,含1个胰岛素生长因子结合蛋白同源物(IB)结构域和1个甲状腺球蛋白Ⅰ型重复(TY)结构域,有26个磷酸化位点(包括17个丝氨酸位点、5个苏氨酸位点和4个酪氨酸位点)和3个N-糖基化位点。序列同源性方面猪IGFBP3蛋白与水牛、黄牛、山羊、绵羊、猫、狗、小鼠、大鼠、鸡和鸭的氨基酸序列同源性分别为91.2%、90.8%、87.8%、87.8%、87.2%、86.9%、82.3%、81.2%、73.9%和73.3%。系统进化树构建显示,猪IGFBP3蛋白与水牛、黄牛、绵羊和山羊的亲缘关系最近。结论:预测结果为进一步研究猪IGFBP3基因及其编码蛋白的结构和生物学功能提供基础。

关键词: IGFBP3基因 生物信息学分析 同源性

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猪NR4A1基因的多态性与产仔数性状的关联分析

养猪 2021

摘要:通过比较序列测定法,在NR4A1基因第5内含子发现A/G突变,建立了PCR-DdeI-RFLP分型技术,并在3个中外猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率,还在长白猪猪群中检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析.结果表明,在长白猪猪群中,所有胎次产仔数呈现GG>AG>AA的趋势.其中,GG型个体和AG型个体的所有胎次产仔数分别显著高于AA型个体(P<0.05).因此,NR4A1基因在长白猪猪群中与产仔数性状显著性相关,可能为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记.

关键词: NR4A1 产仔数 关联分析

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巴克夏猪、霍寿黑猪及其杂交后代ESR基因和FSHβ基因多态性的检测

中国畜牧杂志 2021 北大核心

摘要:本研究采用PCR和酶切方法检测了32头巴克夏猪、48头霍寿黑猪、105头巴克夏猪×霍寿黑猪ESR基因和FSHβ基因多态性,并分析多态位点在3个猪群中的分布特征。结果表明:巴克夏猪ESR基因PvuII酶切位点仅检测到AA型;霍寿黑猪ESR基因呈中度多态,AB和BB型频率高于AA型,等位基因B频率高于A;巴克夏猪×霍寿黑猪ESR基因呈中度多态,AB型频率依次高于AA和BB型,等位基因A频率高于B。巴克夏猪FSHβ基因呈中度多态,BB型频率依次高于AB和AA型,等位基因B频率高于A;霍寿黑猪FSHβ基因呈中度多态,AB型频率高于BB和AA型,等位基因B频率略高于A;巴克夏猪×霍寿黑猪FSHβ基因呈中度多态,AB型频率依次高于BB和AA型,等位基因B频率高于A。本研究结果为开展猪产仔数的标记辅助选择提供了基础。

关键词: 巴克夏猪 霍寿黑猪 ESR FSHβ 基因多态性

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猪CD8B基因编码区克隆和序列分析

基因组学与应用生物学 2020 北大核心 CSCD

摘要:本研究旨在克隆猪CD8B基因的编码区及检测其碱基变异,并利用生物信息学对CD8B基因及其编码的蛋白质序列进行分析.提取大白猪脾脏总RNA后,用RT-PCR扩增CD8B基因.结果 表明,扩增得到长785 bp猪CD8B基因序列,包含完整的630 bp编码区(共编码209个氨基酸),并检测到1个同义突变(c.204A/G).经预测,猪CD8β蛋白的分子式为C1053H1702N296O279S10,分子量为23 293.51,理论等电点为10.24,不稳定系数为50.40,平均亲水性系数为-0.041;二级结构以无规卷曲、延伸链为主,含1个IgV样结构域;存在1个长21个氨基酸残基的信号肽和1个跨膜区;含1个N-糖基化位点和4个O-糖基化位点.同源性分析表明,猪CD8β蛋白与8个哺乳动物(普通牛,水牛,山羊,绵羊,猫,狗,小鼠,大鼠)的相似性在49%以上.分子进化分析表明,猪CD8β蛋白与普通牛、水牛、山羊、绵羊的亲缘关系最近,其次是猫、狗,最远的是小鼠、大鼠.本试验为研究猪CD8B基因的结构和免疫功能提供基础资料.

关键词: CD8B基因 编码区 序列分析

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定远猪新品系生长性能及采食行为分析

养猪 2020

摘要:为探讨定远猪新品系生长肥育期生长性能和采食行为,利用菩提果9ZC型种猪性能智能测定系统对25~90 kg阶段的定远猪新品系各30头进行了测定.结果表明,公猪自24.62 kg至93.06 kg阶段的日增重、料重比、日采食量、日采食时间、采食速度和日采食次数分别为547.5 g、3.36、1.840 kg、77.00 min、23.90 g/min、6.25次,母猪自23.58 kg至90.32 kg阶段分别为533.9 g、3.46、1.847 kg、82.04 min、22.51 g/min、6.48次,公猪的日增重、采食速度略高于母猪(P>0.05),料重比、日采食量、日采食时间、采食次数略低于母猪(P>0.05);日增重、料重比、日采食量、采食速度、日采食次数随着体重增长而增加,而日采食时间随着体重增长而降低;采食行为多发生在白昼,公、母猪平均白昼采食量分别占日采食量的74.73%和73.80%,平均白昼采食时间分别占日采食时间的73.17%和72.44%,夜间采食行为约占全天采食时间的1/4,因此养殖过程中要注重夜间补食,以满足猪群的生长需求.

关键词: 定远猪新品系 生长性能 采食行为

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猪ALAS1基因的多态性与产仔数性状的关联分析

养猪 2020

摘要:通过比较序列测定法,在ALAS1基因第9内含子发现T/C突变,建立了PCR-MspI-RFLP分型技术,并在3个中外猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率,还在长白猪和淮猪新品系Ⅱ猪群中检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析.结果表明,长白猪和淮猪新品系Ⅱ猪群中,所有胎次产仔数都呈现CC>TC>TT的趋势.其中,CC型个体和TC型个体的所有胎次产仔数分别显著高于TT型个体(P<0.05).因此,ALAS1基因在两个猪群中与产仔数性状显著相关,可能为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记.

关键词: ALAS1 产仔数 关联分析

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