文献类型: 中文期刊
作者: 许金根 1 ; 顾有方 1 ; 王重龙 2 ; 李升和 1 ; 李庆岗 2 ;
作者机构: 1.安徽科技学院动物科学学院
2.安徽省农业科学院畜牧兽医研究所
关键词: 猪;CD8B基因;编码区;序列分析
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2020 年 39 卷 011 期
页码: 5059-5066
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究旨在克隆猪CD8B基因的编码区及检测其碱基变异,并利用生物信息学对CD8B基因及其编码的蛋白质序列进行分析.提取大白猪脾脏总RNA后,用RT-PCR扩增CD8B基因.结果 表明,扩增得到长785 bp猪CD8B基因序列,包含完整的630 bp编码区(共编码209个氨基酸),并检测到1个同义突变(c.204A/G).经预测,猪CD8β蛋白的分子式为C1053H1702N296O279S10,分子量为23 293.51,理论等电点为10.24,不稳定系数为50.40,平均亲水性系数为-0.041;二级结构以无规卷曲、延伸链为主,含1个IgV样结构域;存在1个长21个氨基酸残基的信号肽和1个跨膜区;含1个N-糖基化位点和4个O-糖基化位点.同源性分析表明,猪CD8β蛋白与8个哺乳动物(普通牛,水牛,山羊,绵羊,猫,狗,小鼠,大鼠)的相似性在49%以上.分子进化分析表明,猪CD8β蛋白与普通牛、水牛、山羊、绵羊的亲缘关系最近,其次是猫、狗,最远的是小鼠、大鼠.本试验为研究猪CD8B基因的结构和免疫功能提供基础资料.
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