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大别山牛瘤胃大小比较及其相关调控基因表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 章会斌 1 ; 王博 1 ; 金磊 1 ; 金海 1 ; 杜欣怡 1 ; 李倩 1 ; 李庆岗 1 ; 赵拴平 1 ; 朱勇 2 ; 徐磊 1 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院畜牧兽医研究所/安徽省畜禽产品安全重点实验室

2.太湖县久鸿农业综合开发有限责任公司

关键词： 大别山牛;瘤胃;转录组;调控网络

期刊名称： 中国畜禽种业

ISSN： 1673-4556

年卷期： 2025 年 21 卷 009 期

页码： 76-85

摘要： 该研究旨在解析大别山牛瘤胃大小的关键调控基因及分子机制,为地方牛种质改良提供理论依据.选取24月龄、体重相近的大别山牛母牛20头,测定宰前活重及瘤胃重量,根据瘤胃重量及其占比,筛选出瘤胃重量较高组(H组)和较低组(L组)各3头,采集瘤胃组织样本.利用Illumina Hiseq 2000平台进行转录组测序.结果显示,H组瘤胃重量及占宰前活重比例均显著高于L组(P<0.05),两组宰前活重无显著差异(P>0.05).在两组中共鉴定出449个差异表达基因,其中348个在H组上调,101个下调.GO功能注释显示差异表达基因显著富集于代谢、免疫、催化活性、转运蛋白活性、转录因子结合等条目.KEGG通路富集分析表明差异表达基因显著富集于免疫相关通路、代谢功能调控通路、昼夜节律调控通路以及参与细胞组织结构和功能的通路.基于PPI网络分析和degree算法,鉴定出PTGS2、BCL2、GRO1、IL6R和INSR 5个关键节点基因可能参与大别山牛瘤胃免疫-代谢-组织结构的调控.该研究通过比较分析瘤胃大小差异的大别山牛瘤胃转录组,建立了与大别山牛瘤胃免疫-代谢-组织结构相关的调控网络,并筛选出PTGS2、BCL2、GRO1、IL6R和INSR这5个网络核心基因,它们可能通过协同调控瘤胃发育.

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