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陆地棉苗期低温胁迫下cDNA-AFLP差异表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 卫珺 1 ; 王旺华 1 ; 樊洪泓 1 ; 李廷春 1 ; 蔡永萍 1 ; 林毅 1 ;

作者机构： 1.安徽农业大学生命科学学院

关键词： 陆地棉;低温胁迫;cDNA-AFLP;基因差异表达;转录衍生片段

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2012 年 24 卷 05 期

页码： 386-392

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以陆地棉品系棕彩选1号为材料,利用cDNA-AFLP技术研究棉花低温处理前后基因表达的差异。试验采用64对引物组合进行扩增,共获得2321个条带,从中得到34条表达存在差异的条带。根据表达模式的不同,对其中表达存在差异的22个转录衍生片段(Transcripts derived fragments,TDFs)进行了克隆、测序和序列分析。结果表明:在低温胁迫条件下获得的18条TDFs中,上调表达2条(11%),下调表达9条(50%),另外7条(39%)为瞬时表达;而在恢复2 d后得到了4条特异表达的TDFs。22个TDFs中,21个TDFs与NCBI中已知功能基因存在同源性,这些基因包括假定蛋白、转座子、线粒体、过氧化物酶体增殖物激活受体和逆境胁迫反应关键基因等。另有1个TDFs无同源序列。

  • 相关文献

[1]Variations of DNA methylation and genes expression for brown fiber during its development process. Li, Zhenpeng,Li, Tingchun,Fan, Honghong,Guo, Ning,Sun, Xu,Cai, Yongping,Lin, Yi,Li, Zhenpeng,Li, Tingchun.

[2]陆地棉ADH基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 李常凤,徐道青,韩文兵,张小娟,齐苗,添长久,郑曙峰. 2018

[3]陆地棉HD-ZIP_N基因家族的全基因组分析. 叶泗洪,季美君,陈奇,冯群,王冬梅,孙萌,邓小楠,汪睿,韩文兵,汪保华. 2023

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