科研产出
鸡主要组织相容性复合体Ⅰβ微球蛋白(β2m)基因的克隆及序列分析
《中国畜牧兽医 》 2014 北大核心
摘要：为深入了解鸡主要组织相容性复合体Ⅰ(major histocompatibility complex classⅠ,MHCⅠ)β微球蛋白(β2m)分子的特征,研究β2m的免疫作用机理,试验通过RT-PCR技术获得了15条3个地方品种鸡完整的典型的MHCⅠβ2 m基因,将该序列与GenBank数据库中登录的鸭、人、鼠、鱼、猴、马和猪7个不同物种的MHCⅠβ2m分子序列进行了比对分析。结果显示,15条鸡β2m氨基酸序列同源性在98.0%~100%之间,大部分序列完全一致。鸡β2m氨基酸序列与鸭同源性最高,为60.6%;最低的则是来源于草鱼的β2m氨基酸序列,仅为33.3%。遗传进化分析进一步证实鸡与鸭的MHCⅠβ2m亲缘关系较近,与其他物种则遗传距离较远。此外,序列分析发现鸡β2 m基因高度保守,仅个别碱基发生突变。其成熟肽序列的第24和79位为半胱氨酸,在所比对的动物中均未发生突变;同时在成熟肽的第77~83位之间存在免疫球蛋白超基因家族的特征基序"YXCXVXH"。研究结果表明,鸡与其他物种的MHCⅠβ2m分子具有相同的免疫功能基本单位,同时又具备独特的结构特点。
关键词： 鸡主要组织相容性复合体 β微球蛋白基因 序列分析
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禽呼肠孤病毒AH11株的鉴定与人工感染研究
《中国家禽 》 2013 北大核心
摘要：通过SPF鸡胚接种,自疑似病毒性关节炎青脚麻鸡的关节液中分离出一株病毒。采用PCR获得了该病毒的S1基因部分序列,该序列与GenBank中7个禽呼肠孤病毒(ARV)代表性分离株的相应基因序列进行同源性分析结果表明,扩增序列与所比较序列同源性在80.5%~98.0%之间,表明所分离病毒为ARV(命名为ARV-AH11株)。该毒株接种1日龄SPF鸡,可引起严重的生长不良和部分鸡脚爪变形,且攻毒组鸡ARV抗体均为阳性(抗体效价平均为1∶2007.1)。
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安徽两个鸡场ALV-J分离株gp85基因的克隆及序列分析
《动物医学进展 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为研究J-亚群禽白血病病毒(ALV-J)在安徽省鸡群中的遗传变异趋势,对分离到的2株安徽省ALV-J毒株,克隆了其gp85基因序列,并与国内外分离毒株的相应基因序列进行了比较。结果显示,ALVJ gp85基因序列具有高度的易变性,可变氨基酸残基占全长序列的22.8%。其中高变区hr1和hr2具有较多的可变位点,而可变区vr2和vr3相对较为保守。二级结构预测显示ALV-J gp85蛋白含有大量的无规则卷曲结构,尤其是hr2区域。同源性分析表明,毒株AH1103和AH1104的gp85氨基酸序列同源性为95.8%;毒株AH1103与毒株BJ090201J,ev/J的gp85序列同源性最高,毒株AH1104的gp85序列则与国内毒株HuB09JY04的同源性最高。进化分析显示,毒株AH1103和AH1104均与国内毒株NX0101和SD07LK1及美国分离株4817的遗传距离较远。
关键词： J-亚群禽白血病病毒 gp85基因 序列分析
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J亚群禽白血病病毒安徽分离株的鉴定及其gp85基因序列分析
《中国畜牧兽医 》 2012 北大核心
摘要：从安徽省的黄羽肉鸡和罗曼蛋鸡中各分离鉴定出1株J亚群禽白血病病毒,克隆获得了2条相应的gp85基因序列,并与参考毒株进行序列比对。结果表明,两分离毒株与J亚群参考毒株同源性为82.1%～99.4%,分离毒株之间同源性为85.4%。其中肉鸡分离毒株与J亚群原型毒株HPRS-103同源性为97.1%,与J亚群国内毒株SD09TA04、SDYC02J同源性均为99.4%;蛋鸡分离毒株与HPRS-103的同源性为89.0%,与SD09TA04和SDYC02J同源性仅为88.6%。两分离毒株的gp85氨基酸序列出现突变和缺失,在高变区hr1、hr2变异明显。进化分析进一步表明,2个分离毒株亲缘关系较远,可能来源于不同的原始病毒株。
关键词： J亚群禽白血病病毒 安徽分离毒株 gp85基因 序列分析
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鸭黄病毒安徽分离株NS5基因部分片段的克隆和序列分析
《动物医学进展 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为研究鸭黄病毒安徽分离株遗传变异情况,通过RT-PCR获得了鸭黄病毒(Duck flavivirus)安徽分离株NS5部分基因序列DFV-NS5-1,并将该序列与GenBank数据库中登录的9条NS5基因相应序列进行比对分析。同源性分析发现克隆获得的DFV-NS5-1与国内近年来分离的黄病毒属恩塔亚病毒群的鸭坦布苏病毒基因序列同源性较高,均为98%以上;而与国外鸭坦布苏病毒NS5的EU303233基因序列的同源性相对较低,为88.5%。此外,与虫媒黄病毒属的西尼罗病毒、圣路易脑炎病毒和罗西奥病毒NS5的AF481864、EU090146和AY632542基因序列的相似度最高为74.5%。进化分析表明,DFV-NS5-1与来自于国内毒株的JQ289550、JQ314465、JF895923、JF523187和JF232077亲缘关系较近,具有共同的进化祖先,而与虫媒黄病毒属的西尼罗病毒、圣路易脑炎病毒和罗西奥病毒的遗传距离则较远。
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五华鸡J亚群白血病病毒env部分基因的克隆和序列分析
《中国畜牧兽医 》 2011 北大核心
摘要：本试验通过PCR技术获得了安徽省地方品种五华鸡禽白血病病毒J亚群(avian leukosis virus subgroup J,ALV-J)env部分基因序列ALV-J-env1,并将该序列与GenBank数据库中登录的8条env基因相应序列进行了比对分析。结果表明,五华鸡已经感染了J亚群禽白血病,且部分鸡个体已经发病。通过分析可见,ALV-J-env1与所比较的基因序列同源性介于94.2%～96.6%之间,说明不同毒株之间的env基因有一定变异。但与ALV-J-env1同源性最高的是来自于中国ALV-J毒株的HQ425636和HM235665基因序列,且在进化树中聚集为一组,暗示它们之间亲缘关系较近,由共同的毒株进化而来。与ALV-J-env1同源性最低的是来源于马来西亚毒株的AY312965基因序列,遗传进化分析也进一步证实,两者之间亲缘关系较远。
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五华鸡J亚群白血病病毒env部分基因的和序列分析
《中国畜牧兽医 》 2011 北大核心
摘要：本试验通过PCR技术获得了安徽省地方品种五华鸡禽白血病病毒J亚群(avian leukosis virus subgroup J,ALV-J)env部分基因序列AL V-J-env1,并将该序列与GenBank数据库中登录的8条env基因相应序列进行了比对分析.结果表明,五华鸡已经感染了J亚群禽白血病,且部分鸡个体已经发病.通过分析可见,AL V-J-env1与所比较的基因序列同源性介于94.2%~96.6%之间,说明不同毒株之间的env基因有一定变异.但与ALV J-env1同源性最高的是来自于中国ALV-J毒株的HQ425636和HM235665基因序列,且在进化树中聚集为一组,暗示它们之间亲缘关系较近,由共同的毒株进化而来.与ALV-J-env1同源性最低的是来源于马来西亚毒株的AY312965基因序列,遗传进化分析也进一步证实,两者之间亲缘关系较远.
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砀山酥梨果实苯丙氨酸解氨酶基因cDNA克隆及序列分析
《激光生物学报 》 2010 CSCD
摘要：为了研究梨石细胞形成与木质素合成的关系,以砀山酥梨果实为材料,通过基于同源性的RT-PCR方法,克隆木质索合成途径中的关键酶苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因。同时利用基因数据库资料对克隆的PAL,序列进行比较分析。结果表明,从砀山酥梨果实中克隆的PAL基因cDNA片段长度为585 bp,推断其编码195个氨基酸序列。该序列包含与其它植物PAL相同的活性催化位点,经序列分析和同源性比对,该氨基酸序列与其它植物PAl氨基酸序列的同源性在90%以上。系统进化树分析表明,砀山酥梨PAL氨基酸序列与蔷薇科的甜樱桃PAL氨基酸序列聚类关系最近。
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棉铃虫多核衣壳型多角体病毒fp25K基因的克隆及分析
《安徽农业科学 》 2008 CSCD
摘要：[目的]克隆棉铃虫多核衣壳型多角体病毒(HearMNPV)fp25K基因,为深入研究杆状病毒的进化机制提供依据。[方法]通过半补齐法建立HearMNPV的质粒基因组文库,对插入片段进行鉴定和序列分析获取HearMNPVfp25K基因。[结果]HearMNPVfp25K基因的读码框由588个核苷酸组成,编码195个氨基酸;该基因上游具有晚期调控保守序列ATAAG,是一个晚期表达基因;HearMNPVfp25K存在5个α-螺旋,8个β-折叠;HearMNPV与蓓带夜蛾核型多角体一致性最高,达97.0%,与舞毒蛾多核衣壳型多角体的FP’同源性最低,仅为19.3%。HearMNPV与G...
关键词： 棉铃虫多核衣壳型多角体病毒 fp25K基因 序列分析
