科研产出
猪MMP9基因的多态性与产仔数性状的关联分析
《安徽农业科学 》 2023
摘要：通过比较序列测定法，在MMP9基因第10内含子发现C/T突变，建立了PCR-SmaI-RFLP分型技术，并在淮猪新品系Ⅱ猪种中进行多态性分型，分析其基因型频率和等位基因频率，检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析。结果表明，在淮猪新品系Ⅱ猪群中，所有胎次产仔数呈TC＞CC＞TT的趋势，TC型个体的所有胎次产仔数显著高于CC型个体0.776头（P＜0.05）。因此，MMP9基因在淮猪新品系Ⅱ猪群中与产仔数性状显著相关，为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记。
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猪ADAMTS1基因的多态性与产仔数性状的关联分析
《养猪 》 2022
摘要：通过比较序列测定法，在ADAMTS1基因第7外显子发现C/G突变，建立了PCR-PvuⅡ-RFLP分型技术，并在淮猪新品系Ⅱ猪种中进行多态性分型，分析其基因型频率和等位基因频率，检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析。结果表明，在淮猪新品系Ⅱ猪群中，所有胎次产仔数呈现AB>BB>AA的趋势，AB型个体的所有胎次产仔数显著高于BB型个体0.665头（P<0.05）。因此，ADAMTS1基因在淮猪新品系Ⅱ猪群中与产仔数性状显著相关，可能为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记。
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猪NR4A1基因的多态性与产仔数性状的关联分析
《养猪 》 2021
摘要：通过比较序列测定法,在NR4A1基因第5内含子发现A/G突变,建立了PCR-DdeI-RFLP分型技术,并在3个中外猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率,还在长白猪猪群中检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析.结果表明,在长白猪猪群中,所有胎次产仔数呈现GG>AG>AA的趋势.其中,GG型个体和AG型个体的所有胎次产仔数分别显著高于AA型个体(P<0.05).因此,NR4A1基因在长白猪猪群中与产仔数性状显著性相关,可能为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记.
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猪IGFBP3基因生物信息学分析
《安徽科技学院学报 》 2021
摘要：目的:对猪胰岛素样生长因子结合蛋白（IGFBP3）基因的结构与功能进行生物信息学分析。方法:用分子生物学软件分析猪IGFBP3基因序列和IGFBP3蛋白的理化性质、二级结构、结构域、信号肽、跨膜结构、磷酸化和糖基化位点,以及不同动物IGFBP3氨基酸序列的同源性和遗传进化。结果:猪IGFBP3基因编码区长882个碱基对（bp）,编码293个氨基酸。猪IGFBP3蛋白分子式为C1 359H2 182N418O411S24,相对分子质量为31 722.27,理论等电点为8.97,不稳定系数为48.17,脂肪系数为61.06,平均亲水系数为-0.592。IGFBP3蛋白存在1个长27个氨基酸残基的信号肽,但无跨膜结构,二级结构以无规卷曲（65.87%）和α螺旋（20.82%）为主,含1个胰岛素生长因子结合蛋白同源物（IB）结构域和1个甲状腺球蛋白Ⅰ型重复（TY）结构域,有26个磷酸化位点（包括17个丝氨酸位点、5个苏氨酸位点和4个酪氨酸位点）和3个N-糖基化位点。序列同源性方面猪IGFBP3蛋白与水牛、黄牛、山羊、绵羊、猫、狗、小鼠、大鼠、鸡和鸭的氨基酸序列同源性分别为91.2%、90.8%、87.8%、87.8%、87.2%、86.9%、82.3%、81.2%、73.9%和73.3%。系统进化树构建显示,猪IGFBP3蛋白与水牛、黄牛、绵羊和山羊的亲缘关系最近。结论:预测结果为进一步研究猪IGFBP3基因及其编码蛋白的结构和生物学功能提供基础。
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猪ALAS1基因的多态性与产仔数性状的关联分析
《养猪 》 2020
摘要：通过比较序列测定法,在ALAS1基因第9内含子发现T/C突变,建立了PCR-MspI-RFLP分型技术,并在3个中外猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率,还在长白猪和淮猪新品系Ⅱ猪群中检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析.结果表明,长白猪和淮猪新品系Ⅱ猪群中,所有胎次产仔数都呈现CC>TC>TT的趋势.其中,CC型个体和TC型个体的所有胎次产仔数分别显著高于TT型个体(P<0.05).因此,ALAS1基因在两个猪群中与产仔数性状显著相关,可能为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记.
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猪CD8B基因编码区克隆和序列分析
《基因组学与应用生物学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在克隆猪CD8B基因的编码区及检测其碱基变异,并利用生物信息学对CD8B基因及其编码的蛋白质序列进行分析.提取大白猪脾脏总RNA后,用RT-PCR扩增CD8B基因.结果 表明,扩增得到长785 bp猪CD8B基因序列,包含完整的630 bp编码区(共编码209个氨基酸),并检测到1个同义突变(c.204A/G).经预测,猪CD8β蛋白的分子式为C1053H1702N296O279S10,分子量为23 293.51,理论等电点为10.24,不稳定系数为50.40,平均亲水性系数为-0.041;二级结构以无规卷曲、延伸链为主,含1个IgV样结构域;存在1个长21个氨基酸残基的信号肽和1个跨膜区;含1个N-糖基化位点和4个O-糖基化位点.同源性分析表明,猪CD8β蛋白与8个哺乳动物(普通牛,水牛,山羊,绵羊,猫,狗,小鼠,大鼠)的相似性在49%以上.分子进化分析表明,猪CD8β蛋白与普通牛、水牛、山羊、绵羊的亲缘关系最近,其次是猫、狗,最远的是小鼠、大鼠.本试验为研究猪CD8B基因的结构和免疫功能提供基础资料.
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种猪跨群体遗传联系评价的方法和应用
《中国畜牧杂志 》 2020 北大核心
摘要：在猪联合育种中,场间关联率(CR)常作为确定不同种猪群体能否开展联合遗传评估的指标,该指标则依赖于表型和系谱记录。随着猪基因组选择技术(Genomic Selection,GS)在现场育种中的应用和逐步推进,利用全基因组分子标记信息实现遗传背景较为接近的多个种猪群体的跨场联合遗传评估,是加快遗传进展的重要途径。然而,作为基因组联合遗传评估的基础,不同群体之间遗传联系的评价方法还是主要围绕对联合遗传评估结果的定性评价上。利用基因组信息来更加直接或定量的评价不同群体之间的遗传联系,对参考群体构建及育种目标的选择均会有积极的指导意义。本文综述了跨群体遗传联系评价的方法,并分别介绍了其在奶牛和猪联合育种中的应用情况,为探索更适合联合遗传评估群体间遗传联系评价的方法提供参考和思路。
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猪CD4基因多态性及生物信息学分析
《基因组学与应用生物学 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：本研究利用PCR-RFLP方法检测猪CD4基因部分外显子区的单核苷酸多态性,分析CD4基因SNPs之间的连锁不平衡程度,并采用生物信息学软件预测SNPs对CD4蛋白的潜在影响,为猪的抗病育种研究提供相应的分子标记。研究表明,大白猪CD4基因外显子4、6和7都存在一个突变位点,分别可使CD4蛋白T80S、P290L和M348I发生改变;每个SNP位点都有三种基因型,多态信息含量均处于中等多态(0.25
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猪PIT-1基因多态性与生长性状的关联分析
《安徽科技学院学报 》 2017
摘要：目的:研究猪PIT-1基因多态性及其对生长性状的遗传效应,旨在寻找改良猪生长性能的分子标记。方法:采用PCR-RFLP方法检测猪PIT-1基因的单核苷酸多态性(SNP),并分析基因多态性与生长性状的关联性。结果:猪PIT-1基因的Rsa I酶切位点存在多态性。其中,杜洛克猪未检测到AA型,BB基因型频率高于AB型,等位基因B频率高于等位基因A,SNP处于低度多态(PIC<0.25);淮猪新品系未检测到BB型,AA基因型频率高于AB型,等位基因A频率高于等位基因B,SNP处于低度多态(PIC<0.25);杜洛克猪×淮猪新品系未检测到BB型,AB基因型频率高于AA型,等位基因A频率高于等位基因B,SNP处于中度多态(0.25
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猪CD4基因编码区及其剪接体克隆与表达分析
《农业生物技术学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：白细胞分化抗原4(cluster of differentiation 4,CD4)是一种主要表达在CD4+细胞膜上的共受体和信号转导分子。CD4分子参与识别主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)Ⅱ类分子,在T淋巴细胞亚群的发育、分化以及CD4+细胞抗原识别过程中发挥重要功能。本研究旨在克隆猪(Sus scrofa)CD4基因及其剪接体编码区(coding sequence,CDS),并揭示CD4 m RNA在猪组织中的表达特征。根据猪CD4 m RNA序列(Gen Bank登录号:AY515292),利用反转录PCR(reverse transcriptionPCR,RT-PCR)扩增大白猪CD4基因的编码区,并分析CD4基因选择性剪接在不同组织中的表达情况。同时,用荧光定量PCR(quantitative Real-time PCR,q RT-PCR)分析CD4 m RNA在大白猪不同组织中的表达谱,以及在大白猪、长白猪和松辽黑猪3个免疫组织中的表达量。结果显示,通过RT-PCR、克隆和测序,获得两种猪CD4编码序列(Gen Bank登录号:KC333253和KC333254),其中完整型(1 375 bp)和剪接型(1 252 bp)CD4分别编码457和397个氨基酸;两种CD4编码序列在猪外周血、胸腺、淋巴结和脾脏中均有表达,其中完整型CD4的表达量要高于剪接型。q RT-PCR结果表明,猪CD4基因在脾脏中的表达量显著高于肝脏、胃、肾脏、心脏和肌肉(P<0.05);同一免疫组织的CD4 m RNA含量在大白猪、长白猪和松辽黑猪之间没有显著差异(P>0.05),而3个猪种都是胸腺中的CD4基因表达量显著高于在脾脏和淋巴结中(P<0.05)。本研究为进一步探究猪CD4基因的结构和功能提供基础资料。
关键词： 猪 白细胞分化抗原4(CD4) 基因克隆 选择性剪接 组织表达
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