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苹果Ty1-copia类逆转座子LTR_(10)序列及其在苹果属植物中的遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙俊 1 ; 房经贵 2 ; 王飞 2 ; 孙其宝 2 ; 章镇 2 ; 王昆 2 ;

作者机构： 1.南京农业大学园艺学院

2.南京农业大学园艺学院;安徽农业大学园艺学院;安徽省农业科学院园艺研究所;中国农业科学院果树研究所

关键词： 苹果;Ty1-copia类逆转座子LTRs;调控元件;遗传多样性

期刊名称： 南京农业大学学报

ISSN： 1000-2030

年卷期： 2010 年 33 卷 01 期

页码： 43-48

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用改良的Pearce方法分离苹果Ty1-copia类逆转座子RNaseH-LTRs,分离到的RNaseH-LTR_(10)序列已在GenBank注册(登录号DQ534515),该序列长度为299 bp。分析结果表明其5′端为含有终止密码子的RNaseH基因,PPT(polypurinetract)之后是3′-LTR,PPT起始于终止密码子内10 bp处,3′-LTR的起始标志末端倒转重复序列(inverted repeat,IR)TG紧随其后。LTR_(10)的正链和反链均含有多个启动子的特征结构TATA box和CAAT box,α-淀粉酶启动子的保守序列及受不同胁迫条件作用的调控元件,如AuxRE、ABRE、HSE等。利用A-SAP技术研究了LTR_(10)逆转座子在苹果属8个野生种和22个栽培品种中的遗传多样性,多态性片段比例为86.5%;品种长祝较祝光少1条约400 bp的特异性扩增条带。

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