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苹果中Ty1-copia型逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙俊 1 ; 房经贵 1 ; 高兵 1 ; 章镇 1 ; 孙其宝 2 ;

作者机构： 1.南京农业大学园艺学院

2.安徽省农业科学院园艺研究所

关键词： 逆转座子;逆转录酶;苹果;异质性;进化

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1001-7364

年卷期： 2005 年 22 卷 03 期

页码： 193-197

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用苹果叶片为材料,通过PCR扩增、克隆研究了苹果中Ty1-copia型逆转座子的逆转录酶序列。结果表明:(1)逆转座子在1个砧木及7个品种中都能检测到,说明逆转座子在苹果砧木及不同种质中普遍存在。(2)克隆、分析了嘎拉品种中23条逆转座子的逆转录酶序列,分析表明同一基因组中克隆到的逆转录酶序列存在高度的异质性,具体表现为23条逆转录酶序列核苷酸序列长度变化范围是247-279bp,其长度相差32bp,主要表现为缺失突变;其中6条序列中存在1-4个程度不同的终止密码子突变;氨基酸序列同源性的变化范围为21%-98.9%。(3)将23条序列与已发表的不同物种同一类型逆转座子的逆转录酶序列进行聚类分析,表明苹果的Ty1-copia型逆转座子与甜菜、水稻、马铃薯、燕麦及挪威云杉等物种的同类型逆转座子可能有相同的起源。

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