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苹果Ty1-copia类逆转座子家族鉴定及特性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙俊 1 ; 房经贵 1 ; 孙其宝 2 ; 章镇 1 ;

作者机构： 1.南京农业大学

2.安徽省农业科学院

关键词： 苹果;Ty1-copia类逆转座子;逆转录酶;进化

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2009 年 29 卷 12 期

页码： 13-17

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据逆转座子RT保守序列设计引物,利用PCR方法从苹果‘嘎拉’中克隆了20条RT片段,分析苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子家族特性及进化关系。结果显示,20条逆转录酶保守序列表现出了高度的异质性。结合已报道的37条苹果Ty1-copia类逆转座子RT片段,构建了系统发育树,发现家族1、3和4中具有转座活性的逆转座子的可能性较大;序列分析表明,Ty1-copia类逆转座子是苹果基因组内序列重组的热点。用RT序列为探针进行Southern杂交,发现苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子拷贝数高、分布广泛。研究结果为进一步分离具有转座活性的苹果Ty1-copia类逆转座子及其人工诱导芽变奠定了基础。

  • 相关文献

[1]苹果中Ty1-copia型逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析. 孙俊,房经贵,高兵,章镇,孙其宝. 2005

[2]沙门氏菌CRISPR序列的结构功能与应用研究进展. 沈学怀,张丹俊,潘孝成,赵瑞宏,戴银,胡晓苗. 2017

[3]苹果元帅系和富士系芽变品种的IRAP鉴定. 孙俊,周军永,孙其宝,王昆. 2010

[4]苹果Ty1-copia类逆转座子LTR_(10)序列及其在苹果属植物中的遗传多样性分析. 孙俊,房经贵,王飞,孙其宝,章镇,王昆. 2010

[5]苹果IRAP反应体系的建立和指纹图谱构建. 周军永,孙其宝,孙俊,王昆. 2010

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