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小麦Wcor15基因上游调控区克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘方方 1 ; 殷桂香 2 ; 佘茂云 3 ;

作者机构: 1.安徽省农业科学院作物研究所

2.;安徽省农业科学院作物研究所

3.;安徽省农业科学院作物研究所;

关键词: 小麦;Wcor15基因;启动子;克隆;生物信息学

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 04 期

页码: 1033-1039

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了克隆小麦Wcor15基因启动子序列和预测可能的表达调控途径,试验设计特异引物采用PCR方法从小麦基因组DNA中直接进行扩增并测序,用Neural Network Promoter Prediction、Promoter SCAN、Promoter 2.0和Meth Primer软件对启动子结构进行分析,PLACE在线分析预测可能的顺式作用元件。结果表明:克隆获得了一段长度为2 046 bp的Wcor15基因上游调控区序列,软件预测显示该区域含有4个可能的启动子,除了具有一般启动子的CAAT-box、TATA-box典型结构外,还含有CBFHV、ACGTATERD1、ABRELATERD1、ARR1AT、CANBNNAPA应答非生物胁迫、激素等重要作用元件。序列比对发现小麦Wcor15启动子与拟南芥cor15a、大麦cor14b的一致性分别为36.92%和40.29%。

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