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资源类型: 中文期刊
关键词:RNA-seq(模糊匹配)
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RNA-Seq技术在桑葚糖代谢中的应用价值探究

产业与科技论坛 2017

摘要:桑葚含有丰富的营养物质和功能成分,具有良好的开发利用前景,选育高品质的果桑已成为研究热点。糖代谢是整个生物代谢的中心,与果实的发育及产量密切相关,对桑葚糖代谢调控机理的研究具有重要的理论与实践意义。本文对RNA-Seq技术在桑葚糖代谢中的应用价值进行综述,以期为进一步通过育种手段实现桑葚增量和有效成分含量的提高提供理论依据。

关键词: 桑葚 RNA-Seq 糖代谢 基因表达

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基于RNA-seq技术对不同品种猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释

西北农林科技大学学报(自然科学版) 2016 北大核心 CSCD

摘要:【目的】筛选皖南花猪和大约克猪背最长肌组织差异表达基因。【方法】采集皖南花猪和大约克猪背最长肌(各3头),测定其肉质性状指标,并提取其RNA,采用高通量转录组测序(RNA-seq)技术进行测序,对所获序列进行GO和Pathway显著性富集分析。【结果】测序后皖南花猪3个样本得到的总序列数分别为65 584 126,64 327 738和59 244 502,其中有效序列达到94.4%,94.3%和94.2%;大约克猪3个样本得到的总序列数分别为57 969 134,68 254 168和72 298 142,其中有效序列达到93.8%,93.7%和93.8%。测序饱和度良好,证明测序数据真实可靠。差异表达分析结果显示,共筛选到347个差异表达基因,其中包含94个上调基因,253个下调基因。GO功能显著性富集和Pathway显著性富集分析发现,差异表达基因富集在与糖酵解代谢和肌肉发育相关的生物学过程中以及与脂肪酸代谢和生长性状、胴体性状相关的信号通路上。【结论】获得了猪背最长肌组织基因表达谱,筛选出了一些与肉质性状和生长性状有关的候选基因。

关键词: RNA-seq 皖南花猪 大约克猪 差异表达基因 背最长肌

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转录组测序(RNA-seq)技术及其应用

农技服务 2015

摘要:转录组的研究可以更好的研究生物体的基因功能、研究结构变异及发现新的基因。RNA-Seq技术作为一种新的高效、快捷的转录组研究手段能够更为快速、准确地为人们提供更多的生物体转录信息。本文主要是介绍几种高通量测序技术的研究平台及其原理、步骤和技术特点等,为以后的相关研究和应用提供参考。

关键词: 转录组 高通量测序技术 RNA-Seq

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转录组测序及其在野生大豆基因资源发掘中的应用

大豆科学 2013 北大核心 CSCD

摘要:野生大豆是栽培大豆的原始祖先种,其遗传多样性远远超过栽培大豆,并且蕴藏着多种优异抗性基因。目前关于野生大豆优异基因挖掘和利用的研究很少,本研究概述了转录组测序的基本原理、实验流程、数据分析和应用现状,并展望了将转录组测序技术应用于野生大豆的研究,可能对野生大豆资源基因发掘和利用及其在大豆种质创新与品种设计育种中产生的影响。将野生大豆研究深入到分子水平,对野生大豆资源的深入研究具有重要理论意义和实践价值。

关键词: 野生大豆 基因资源 转录组测序 挖掘和利用

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