科研产出
猪CAST基因多态性与生物信息学分析
《浙江农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在检测巴克夏猪、霍寿黑猪及其杂交F1代CAST基因多态性,并利用生物信息学分析碱基变异对mRNA二级结构以及CASTⅢ型蛋白的影响.结果表明,巴克夏猪、霍寿黑猪、巴克夏猪×霍寿黑猪都存在AA、AC和CC基因型,等位基因A的频率都高于等位基因C.该突变在3个猪群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),呈中度多态(0.25
关键词： 猪;CAST基因;多态性;生物信息学分析
全文链接
请求原文
猪IGFBP3基因生物信息学分析
《安徽科技学院学报 》 2021
摘要：目的:对猪胰岛素样生长因子结合蛋白（IGFBP3）基因的结构与功能进行生物信息学分析。方法:用分子生物学软件分析猪IGFBP3基因序列和IGFBP3蛋白的理化性质、二级结构、结构域、信号肽、跨膜结构、磷酸化和糖基化位点,以及不同动物IGFBP3氨基酸序列的同源性和遗传进化。结果:猪IGFBP3基因编码区长882个碱基对（bp）,编码293个氨基酸。猪IGFBP3蛋白分子式为C1 359H2 182N418O411S24,相对分子质量为31 722.27,理论等电点为8.97,不稳定系数为48.17,脂肪系数为61.06,平均亲水系数为-0.592。IGFBP3蛋白存在1个长27个氨基酸残基的信号肽,但无跨膜结构,二级结构以无规卷曲（65.87%）和α螺旋（20.82%）为主,含1个胰岛素生长因子结合蛋白同源物（IB）结构域和1个甲状腺球蛋白Ⅰ型重复（TY）结构域,有26个磷酸化位点（包括17个丝氨酸位点、5个苏氨酸位点和4个酪氨酸位点）和3个N-糖基化位点。序列同源性方面猪IGFBP3蛋白与水牛、黄牛、山羊、绵羊、猫、狗、小鼠、大鼠、鸡和鸭的氨基酸序列同源性分别为91.2%、90.8%、87.8%、87.8%、87.2%、86.9%、82.3%、81.2%、73.9%和73.3%。系统进化树构建显示,猪IGFBP3蛋白与水牛、黄牛、绵羊和山羊的亲缘关系最近。结论:预测结果为进一步研究猪IGFBP3基因及其编码蛋白的结构和生物学功能提供基础。
全文链接
请求原文
巴克夏猪、霍寿黑猪及其杂交后代ESR基因和FSHβ基因多态性的检测
《中国畜牧杂志 》 2021 北大核心
摘要：本研究采用PCR和酶切方法检测了32头巴克夏猪、48头霍寿黑猪、105头巴克夏猪×霍寿黑猪ESR基因和FSHβ基因多态性,并分析多态位点在3个猪群中的分布特征。结果表明:巴克夏猪ESR基因PvuII酶切位点仅检测到AA型;霍寿黑猪ESR基因呈中度多态,AB和BB型频率高于AA型,等位基因B频率高于A;巴克夏猪×霍寿黑猪ESR基因呈中度多态,AB型频率依次高于AA和BB型,等位基因A频率高于B。巴克夏猪FSHβ基因呈中度多态,BB型频率依次高于AB和AA型,等位基因B频率高于A;霍寿黑猪FSHβ基因呈中度多态,AB型频率高于BB和AA型,等位基因B频率略高于A;巴克夏猪×霍寿黑猪FSHβ基因呈中度多态,AB型频率依次高于BB和AA型,等位基因B频率高于A。本研究结果为开展猪产仔数的标记辅助选择提供了基础。
全文链接
请求原文
猪CD8B基因编码区克隆和序列分析
《基因组学与应用生物学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在克隆猪CD8B基因的编码区及检测其碱基变异,并利用生物信息学对CD8B基因及其编码的蛋白质序列进行分析.提取大白猪脾脏总RNA后,用RT-PCR扩增CD8B基因.结果 表明,扩增得到长785 bp猪CD8B基因序列,包含完整的630 bp编码区(共编码209个氨基酸),并检测到1个同义突变(c.204A/G).经预测,猪CD8β蛋白的分子式为C1053H1702N296O279S10,分子量为23 293.51,理论等电点为10.24,不稳定系数为50.40,平均亲水性系数为-0.041;二级结构以无规卷曲、延伸链为主,含1个IgV样结构域;存在1个长21个氨基酸残基的信号肽和1个跨膜区;含1个N-糖基化位点和4个O-糖基化位点.同源性分析表明,猪CD8β蛋白与8个哺乳动物(普通牛,水牛,山羊,绵羊,猫,狗,小鼠,大鼠)的相似性在49%以上.分子进化分析表明,猪CD8β蛋白与普通牛、水牛、山羊、绵羊的亲缘关系最近,其次是猫、狗,最远的是小鼠、大鼠.本试验为研究猪CD8B基因的结构和免疫功能提供基础资料.
全文链接
请求原文
IGF-1基因多态性与猪生长性状的相关性分析
《安徽科技学院学报 》 2016
摘要：目的:研究淮猪新品系与杜洛克猪杂交的生产性能,并分析IGF-1基因对猪生长性状的遗传效应。方法:通过ACEMA-64自动饲喂系统测定杜洛克猪、淮猪新品系、杜洛克猪×淮猪新品系的生长性状。另外,用PCR-RFLP方法对测定猪的基因多态性进行检测。结果:杜洛克猪、淮猪新品系×杜洛克猪的平均日增重和达100kg校正日龄都显著优于淮猪新品系(P<0.05);淮猪新品系×杜洛克猪的饲料转化率显著低于淮猪新品系(P<0.05),但也显著高于杜洛克猪(P<0.05)。IGF-1基因PCR产物经Hha I酶切,杜洛克猪仅检测到BB型;淮猪新品系检测到AB和BB型;杜洛克猪×淮猪新品系检测到AA、AB和BB型。关联分析表明,三种基因型个体的平均日增重、饲料转化率和达100kg校正日龄存在差别,但是差异都不显著(P>0.05)。其中,淮猪新品系BB型个体的生长性状有优于AB型的趋势,杜洛克猪×淮猪新品系BB型个体有优于AB和AA型的趋势。结论:淮猪新品系与杜洛克猪杂交效果较好,但IGF基因作为改善猪生长性状的分子标记仍需进一步的验证。
全文链接
请求原文
圩猪和大白猪屠宰测定及肉质分析
《养猪 》 2015
摘要：为研究地方品种圩猪和引进品种大白猪的肉质差异,寻求圩猪的优异肉质特性,选择在相同条件下饲养的90 kg圩猪和大白猪各6头进行屠宰和肉质测定。结果显示,圩猪屠宰率(65.38%)、腿臀比例(29.57%)及眼肌面积(26.58 cm2)均极显著低于大白猪(P<0.01),圩猪实测3点平均背膘厚为24.28 mm,极显著大于大白猪(P<0.01);L45品种间差异不显著,而大白猪L24(58.88)极显著高于圩猪(P<0.01),圩猪a45(16.82,P<0.05)和a24(16.97,P<0.01)均高于大白猪,表明圩猪肉色要深于大白猪,表现出鲜红肉色;p H45和p H24在品种间差异不显著(P>0.05);圩猪失水率为21.12%,比大白猪低6.23个百分点(P<0.01);肌内脂肪含量为2.32%,极显著高于大白猪(1.38%)。在相同的饲养管理及营养水平条件下,圩猪表现出脂肪沉积力强、保水力强、肉色鲜红等优良特性。
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
