文献类型： 中文期刊
作者： 滕斌 1 ; 李泽福 1 ; 罗志祥 1 ; 吴敬德 1 ; 朱学桂 1 ; 宣红 1 ; 张瑛 1 ;
作者机构： 1.安徽省农业科学院水稻研究所
关键词： EcoTILLING;CEL Ⅰ;水稻;基因型;SNP
期刊名称： 农业生物技术学报
ISSN： 1674-7968
年卷期： 2012 年 20 卷 03 期
页码： 254-260
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： EcoTILLING(ecotype targeting induced local lesions in genomes)是一种高通量检测和分析自然群体中单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)变异的研究方法。由于该技术需要高级、精密的仪器设备和昂贵的荧光标记引物来检测CEL(celery)Ⅰ的酶切产物,极大地限制了该技术的应用。本研究对传统EcoTILLING技术做了适当改进,简化了CELⅠ酶的抽提步骤,采用自然冷却方法制备异源双链产物,普通银染检测CELⅠ酶切产物,酶活检测结果显示CELⅠ粗提液对错配产物切割效果良好。利用EcoTILLING简化技术对18份水稻(Oryza sativa L.)品系Wx基因第1内含子5'端的G/T基因型进行了成功鉴定。此外,对18份水稻材料中一417bp长的Wx基因片段实现了CELⅠ酶切条带分型,经测序验证,酶切带型差异能够准确反映材料间SNP的变异。本研究结果表明,应用EcoTILLING简化技术可有效进行水稻基因型鉴定及SNP检测,是开展水稻功能基因组研究的有力工具。
- 相关文献
[1]一种基于PCR的水稻SNP标记检测方法. 王钰,许学,秦瑞英,陆徐忠,李莉,杨剑波,倪金龙,马卉,汪秀峰. 2020
[2]猪CD8B表达谱、基因多态性及其与血液免疫性状的关联分析. 许金根,王重龙,车传燕,蔡治华,李升和,张勤. 2016
[3]绵羊Izumo1基因多态性及其与产羔数关联分析. 胡文萍,董新龙,田志龙,汤继顺,刘秋月,王翔宇,狄冉,张效生,张金龙,王金玉,储明星. 2020
[4]基于李府贡枣转录组测序的SSR和SNP特征分析. 周军永,陆丽娟,刘茂,朱淑芳,仇鹏辉,孙其宝. 2019
[5]Single nucleotide polymorphism scanning and expression of the FRZB gene in pig populations. Wang, Zhixiu,Zhang, Bo,Yang, Yuzeng,Ban, Dongmei,Zhang, Hao,Li, Qinggang,Lu, Yunfeng. 2014
[6]Molecular cloning, tissue expression and association of porcine NR4A1 gene with reproductive traits. Deng, C. Y.,Liu, L. Q..
[7]基因型与地点及互作对小麦淀粉RVA糊化参数的影响. 赵莉,何贤芳. 2009
[8]西瓜裂果性状的基因型研究. 江海坤,袁希汉,章镇,苏小俊,徐海,宋波,陈龙正,安林海,单奇伟,张其安. 2009
[9]芝麻隐性核不育保持系选育与基因型分析. 汪强,赵莉,林勇翔,徐桂珍. 2016
[10]基因型对粳稻花药培养效率的影响. 甘泉,宋丰顺,滕斌,林翠香,倪大虎. 2020
[11]应用AMMI模型分析安徽省油菜区试品种的稳定性. 林凯,江莹芬,郑冬梅,余华胜,汤继保,陈峰. 2006
[12]晚粳新品种M1148的特征特性及栽培技术研究. 吴敬德,吴跃进,童继平,郑乐娅. 2001
[13]不同机插株距对徽两优5号群体结构及产量形成的影响. GAO Shang,高尚,LI Shengqun,李胜群,CHEN Gang. 2015
[14]沿江平原稻麦轮作系统维持钾素平衡和作物高产的钾肥运筹研究. Liu Feng,刘枫,Wu Chuanzhou,吴传洲,Zhu Kebao. 2012
[15]江淮水稻钵苗机插生育特性与高产栽培关键技术研究. WU Wenge,吴文革,张健美,ZHANG Jianmei,ZHOU Yongjin. 2015
[16]水稻氮高效品种的初步筛选. YU Youling,余友玲,WU Wenge,吴文革,CHEN Gang. 2015
[17]水稻强耐热材料筛选及抽穗期高温处理对生理和品质指标的影响. 马廷臣,夏加发,王元垒,唐光勇,李泽福. 2011
[18]安徽省两种不同类型中低产田成因分析. 许有尊,吴文革. 2011
[19]安徽省水稻高产栽培技术研究与集成. 黄义德,杨惠成,陈周前. 2007
[20]安徽省水稻生产现状及其发展对策. 张培江,姜福建,占新春,张明,耿少军,李安林. 2003
作者其他论文 更多>>
-
优质籼型水稻光温敏核不育系'7-163S'特征特性及其基因型解析
作者：张彩娟;周坤能;夏加发;王元垒;云鹏;马廷臣;吴德祥;李泽福
关键词：水稻;籼型光温敏核不育系;’7-163S’;特征特性;基因型解析
-
抗旱优质杂交稻新组合皖两优1008的选育
作者：王士梅;方吴云;朱倩;易月明;龚存力;吴敬德;杨联松
关键词：杂交稻;皖两优1008;抗旱;优质;易制种;选育
-
优质籼型温敏核不育系广茉HS的选育与应用
作者：江建华;党小景;张瑛;王德正
关键词：水稻;温敏核不育系;广茉HS;优质;选育
-
安徽省水稻地方品种资源鉴定评价
作者：周坤能;夏加发;张彩娟;王元垒;云鹏;马廷臣;台德卫;张效忠;荣松柏;李泽福
关键词：水稻;地方品种资源;鉴定与评价;优质;抗稻瘟病;安徽
-
广适籼型两系不育系7011S的选育与应用
作者：从夕汉;阮新民;施伏芝;杜弘杨;罗彦长;罗玉祥;罗志祥
关键词：杂交水稻;温敏核不育系;7011S;选育
-
高配合力籼型光温敏核不育系6022S的选育与应用
作者：从夕汉;阮新民;施伏芝;杜弘杨;罗玉祥;罗志祥
关键词：杂交水稻;光温敏核不育系;6022S;选育;配合力
-
高配合力优质籼型两系不育系504S的选育与应用
作者：从夕汉;阮新民;施伏芝;杜弘杨;罗玉祥;罗志祥
关键词：杂交水稻;温敏核不育系;504S;配合力
