文献类型： 中文期刊
作者： 滕斌 1 ; 李泽福 1 ; 罗志祥 1 ; 吴敬德 1 ; 朱学桂 1 ; 宣红 1 ; 张瑛 1 ;
作者机构： 1.安徽省农业科学院水稻研究所
关键词： EcoTILLING;CEL Ⅰ;水稻;基因型;SNP
期刊名称： 农业生物技术学报
ISSN： 1674-7968
年卷期： 2012 年 20 卷 03 期
页码： 254-260
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： EcoTILLING(ecotype targeting induced local lesions in genomes)是一种高通量检测和分析自然群体中单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)变异的研究方法。由于该技术需要高级、精密的仪器设备和昂贵的荧光标记引物来检测CEL(celery)Ⅰ的酶切产物,极大地限制了该技术的应用。本研究对传统EcoTILLING技术做了适当改进,简化了CELⅠ酶的抽提步骤,采用自然冷却方法制备异源双链产物,普通银染检测CELⅠ酶切产物,酶活检测结果显示CELⅠ粗提液对错配产物切割效果良好。利用EcoTILLING简化技术对18份水稻(Oryza sativa L.)品系Wx基因第1内含子5'端的G/T基因型进行了成功鉴定。此外,对18份水稻材料中一417bp长的Wx基因片段实现了CELⅠ酶切条带分型,经测序验证,酶切带型差异能够准确反映材料间SNP的变异。本研究结果表明,应用EcoTILLING简化技术可有效进行水稻基因型鉴定及SNP检测,是开展水稻功能基因组研究的有力工具。
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