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中华鳖MyoD1基因SNP鉴定及其与生长性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄龙 1 ; 吴本丽 1 ; 何吉祥 1 ; 陈静 1 ; 宋光同 1 ; 汪翔 1 ; 张烨 1 ; 武松 1 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院水产研究所;水产增养殖安徽省重点实验室

关键词： 中华鳖;生肌决定因子1基因;单核苷酸多态性标记;生长性状;关联分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2019 年 04 期

页码： 76-81

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究生肌决定因子1(MyoD1)基因多态性与中华鳖生长性状的相关性,采用直接测序法在MyoD1基因上共检测到6个SNP位点(T-49G、A-38G、C91T、A187T、C880T和T1522A),其中C880T位于外显子上,属于错义突变。对从同批繁殖、同块稻田养殖的2冬龄中华鳖群体中随机选取的178只个体中各位点的基因型进行检测。结果显示,所有位点在中华鳖群体中的平均有效等位基因数、平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为1.636 5、0.349 3和0.375 4,除A187T位点外,其余5个位点的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg定律。采用一般线性模型分析各位点与中华鳖生长性状之间的相关性,研究发现,T-49G位点GG基因型个体的背甲宽显著大于TT基因型,A-38G位点AG基因型个体的背甲宽显著大于AA基因型,A187T位点TT基因型个体的体高显著大于AA基因型,T1522A位点AA基因型个体的体质量显著大于TT、TA基因型,其余位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异。T-49G、A-38G、A187T和T1522A位点与生长性状显著相关,可作为中华鳖分子标记辅助育种的候选标记。

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