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牛PAX3基因结构分析及蛋白功能预测

文献类型: 中文期刊

作者: 赵拴平 1 ; 金海 1 ; 徐磊 1 ; 李默 1 ; 贾玉堂 1 ;

作者机构: 1.安徽省农业科学院畜牧兽医研究所畜禽产品安全工程安徽省重点实验室

关键词: 牛;PAX3;蛋白;生物信息学

期刊名称: 中国草食动物科学

ISSN: 2095-3887

年卷期: 2021 年 41 卷 005 期

页码: 8-11

摘要: 试验旨在探究PAX3蛋白的结构和功能,对后期研究其参与的生理机制提供理论依据.利用生物信息学技术对牛PAX3基因结构、蛋白保守结构域、信号肽剪切位点、理化性质、亲疏水性和亚细胞定位进行分析,并对其二级三级结构进行预测.结果显示,牛PAX3基因编码氨基酸在人、小鼠、大鼠、牛、猪、马、鸡7个物种中高度保守,且均含有配对结构域PAX、低复杂性区域和完全同源结构域HOX;牛PAX3蛋白等电点8.81,半衰期30 h,不稳定指数56.68,为亲水性蛋白,在细胞核分布的概率95.70%,二级结构中存在43个α螺旋,441个无规卷曲,不存在β折叠.综上所述,推测PAX3蛋白存在于细胞核中,通过与亲水性蛋白结合发挥其生物学功能.

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