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薏苡ClSAD、ClFAD2基因单倍型鉴定与相关脂肪酸关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 尚昆 1 ; 付瑜华 1 ; 李秀诗 1 ; 蒙秋伊 1 ; 杨玲玲 1 ; 朱加保 2 ;

作者机构: 1.贵州省农业科学院贵州省亚热带作物研究所

2.安徽省农业科学院棉花研究所

关键词: 薏苡;脂肪酸;单倍型;硬脂酸脱饱和酶SAD基因;油酸脱饱和酶FAD2基因

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2024 年 25 卷 010 期

页码: 1756-1766

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 薏苡仁油是薏苡仁主要功能性物质之一,脂肪酸是其重要组成部分。以中国9个省份的190份薏苡种质为材料,检测其种仁硬脂酸、油酸、亚油酸含量,分析ClSAD、ClFAD2基因序列多态性并鉴定单倍型,进行脂肪酸含量单倍型关联分析。结果表明,不同薏苡种质种仁3种脂肪酸含量存在广泛变异,变异系数为15.84%~23.05%,遗传多样性指数为5.22~5.23,其中油酸含量最高,硬脂酸含量最低,各脂肪酸组分间呈极显著正相关。ClSAD和ClFAD2内部各有14个和3个SNP,分别鉴定到5个单倍型组合,ClSAD基因单倍型Hap3和ClFAD2基因单倍型Hap1分别与参考基因组一致。ClSAD基因单倍型Hap3与硬脂酸含量显著关联且具有负效应,利于硬脂酸向油酸转化。ClFAD2基因单倍型Hap1利于亚油酸的积累,而Hap2与亚油酸酸含量显著关联且具有负效应,不利于亚油酸的合成。在2个基因内部各鉴定到1个关键SNP位点,分别是形成SAD和FAD2酶活性差异的关键位点。研究结果将为高油薏苡优良品种的选育、分子标记开发和相关分子机制解析提供理论基础。

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