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陆地棉ADH基因家族的全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李常凤 1 ; 徐道青 2 ; 韩文兵 2 ; 张小娟 2 ; 齐苗 2 ; 添长久 2 ; 郑曙峰 3 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院棉花研究所

2.;安徽省农业科学院棉花研究所

3.;安徽省农业科学院棉花研究所;

关键词： 陆地棉;ADH基因家族;表达分析;非生物胁迫

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 07 期

页码： 2065-2077

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用生物信息学方法对陆地棉ADH家族基因进行全基因组挖掘和分析,系统地解析Gh ADHs的序列特征、基因结构、染色体分布、非生物胁迫下基因表达模式以及蛋白进化关系、结构域特征与亚细胞定位等。结果表明:陆地棉基因组中共鉴定得到28个ADH,分布在16条染色体上;对应氨基酸可分为ADH1、FDH1、ADH0和BAD1等4个亚家族,长度从292~440个不等。均含有两个主要的结构域:催化结构域及辅酶结合结构域,且具有相同的亚细胞定位;表达分析显示大部分Gh ADHs对ABA、干旱、盐、碱、淹水、低温和高温等1种或多种胁迫表现出显著应答,暗示Gh ADHs在抵抗非生物胁迫中可能发挥重要作用。陆地棉ADH家族基因的鉴定与表达分析,为深入解析ADH响应棉花非生物胁迫中的功能及分子机制奠定了理论基础,进一步为棉花抗逆育种提供更多基因资源。

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