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基于宏基因组分析菌渣微生物群落组成和功能多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 刘雪 1 ; 闫晓明 1 ; 唐俊 2 ; 徐道青 1 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院棉花研究所

2.阜阳师范大学生物与食品工程学院

关键词： 菌渣;宏基因组测序;微生物;有机肥

期刊名称： 安徽农业大学学报

ISSN： 1672-352X

年卷期： 2024 年 51 卷 003 期

页码： 488-494

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究双孢菇菌渣发酵过程中微生物菌群组成变化和功能多样性，对双孢菇菌渣加猪粪混合堆肥的0、8、16和20d样品进行宏基因组测序，分析菌渣堆肥过程中微生物群落组成的变化并挖掘其功能基因。结果表明：（1）双孢菇菌渣有机肥发酵初期0d时与发酵8、16和20d时的微生物群落组成变化较大，同时在KEGG数据库中进行功能多样性分析和聚类分析发现0d、8d样本距离相对较近，16d和20d样本距离相对较近。（2）从不同时间段的菌渣有机肥中一共鉴定出28257个种，其中发酵0、8、16和20d样本物种分别占物种总数的61.04%、85.35%、86.08%和85.40%。（3）自然发酵0d时优势菌门为厚壁菌门，随着发酵时间的增加优势菌门逐渐变为变形菌门、拟杆菌门和放线菌门等；芽孢杆菌科及类芽孢杆菌科在发酵过程中一直为关键菌科；优势菌种为热噬淀粉芽胞杆菌和嗜热芽孢杆菌。（4）菌渣发酵过程中功能基因主要位于碳水化合物代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢和辅因子和维生素的代谢途径；碳水化合物酶占比较多的为糖基转移酶和糖苷水解酶，最低为多糖裂解酶，分别占比为38.8%、38.1%和1.2%；丰度最高的3个抗性基因分别为多耐药性抗性基因、大环内酯抗性基因和四环素抗性基因。

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