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牛GDF8基因编码蛋白结构和功能预测

文献类型： 中文期刊

作者： 赵拴平 1 ; 金海 1 ; 徐磊 1 ; 贾玉堂 1 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院畜牧兽医研究所畜禽产品安全工程安徽省重点实验室

关键词： 牛;GDF8;生物信息学;蛋白结构

期刊名称： 中国草食动物科学

ISSN： 1002-6037

年卷期： 2023 年 43 卷 002 期

页码： 33-36

摘要： 旨在探究GDF8基因(Growth differentiation factor 8)编码蛋白的结构和功能,对后期研究其生理机制提供理论依据.利用生物信息学技术对牛GDF8蛋白二级和三级结构进行了预测,分析了保守结构域、信号肽剪切位点、理化性质、亲疏水性、亚细胞定位和蛋白网络通路.结果显示,牛GDF8蛋白与人和小鼠具有相似的保守结构域,不稳定指数85.52,属于不稳定蛋白,其亲水性氨基酸明显多于疏水性氨基酸,为亲水性蛋白;牛GDF8蛋白在内质网分布的概率44.4%,在线粒体分布的概率33.3%,二级结构以无规则卷曲为主,折叠缠绕后形成三级结构;牛GDF8蛋白PPI网络图有11个节点,其KEGG通路主要与骨骼肌纤维发育、活化素受体信号通路、成肌细胞融合等相关.综上,推测GDF8蛋白存在于内质网和线粒体中,通过与亲水性蛋白结合调节机体生物学功能.

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