科研产出
新杨黑羽蛋鸡育雏期肠道菌群定植规律分析
《上海畜牧兽医通讯 》 2023
摘要：为进一步对新杨黑羽蛋鸡生产技术集成提供技术支持,分别对1日龄和3周龄雏鸡鸡粪中的微生物进行群落全长16SrDNA单分子测序,对其肠道高丰度菌群及其功能进行分析、预测.实验结果显示:从1日龄雏鸡粪便样品中共获得119个运算分类单元(operational taxonomic unit,OTU),检测到58种细菌;从3周龄雏鸡粪便样品中获得1 573个OTU,检测到176种细菌;1日龄和3周龄雏鸡肠道菌群间的丰富度指数Chao1、ACE及多样性指数Simpson存在极显著差异(P<0.01),但多样性指数Shannon差异不显著(P>0.05);1日龄雏鸡的肠道菌群中,相对丰度较高的5种优势菌分别为宋氏志贺菌、红色皱纹单胞菌、维氏气单胞菌、梭状芽孢杆菌和阴沟肠杆菌;3周龄雏鸡的肠道菌群中,相对丰度较高的5种优势菌分别为费格森埃希菌、宋氏志贺菌、不溶菌厌氧支原体、Spiroplasma apis和化糖梭状芽孢杆菌.
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4株禽腺病毒的鉴定和分析
《农业灾害研究 》 2019
摘要：[目的]对六安、郭河、宣城、肥西某养殖户送检的疑似腺病毒的病料进行分离鉴定,为进一步鉴别、预防和控制疾病提供科学的理论依据。[方法]首先采集病例中鸡的肝脏,提取病毒DNA,根据Genbank已登录腺病毒的hexon基因设计引物,通过PCR检测病料中腺病毒,对扩增的序列进行连接转化和阳性克隆子筛选,并对扩增到的序列进行测序鉴定,最后将获得的基因序列构建进化树分析确定安徽省部分地区禽腺病毒血清型。[结果]临床中疑似腺病毒感染的主要症状为心包积液和肝脏肿大,用设计的引物均检测出大小为599 bp的目的基因条带,序列比对结果发现,此次检测的腺病毒均为4型腺病毒。[结论]试验建立了快速检测禽腺病毒的方法,为安徽省地区禽腺病毒防控提供了理论依据。
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绿豆SSR标记的开发及遗传多样性分析
《作物学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：SSR标记以其数量丰富、多态性好、共显性遗传等优点在基础研究和育种工作中发挥了重要作用,但目前绿豆基因组中的SSR标记依然较少。本研究将磁珠富集法和测序技术相结合高通量检测绿豆基因组SSR位点,鉴定出3,275,355个SSR位点,开发了2742个SSR标记。选取其中157个SSR进行PCR验证,发现有90个(57.33%)标记在10份材料中表现出多态性。挑选40个条带清晰、多态性高、染色体上均匀分布的标记对90份绿豆资源进行遗传多样性分析,单个位点检测到的等位变异数为2～8个,平均为3.0个,有效等位基因数为1.31～4.21个,平均为2.16。Nei’s基因多样性指数在0.23～0.76之间,平均为0.51。多态性信息含量为0.22～0.72,平均为0.43。聚类分析将90份材料分为2个类群,包含4个组。第I组主要由北方资源组成,第Ⅱ组种质来源较为分散,第Ⅲ组主要由山东的资源构成,第Ⅳ组包含多数河北的种质资源。本研究开发的多态性SSR标记不仅可以用于绿豆种质资源的遗传多样性分析,也将在高密度遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种中发挥重要作用。
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蓖麻蚕线粒体cox2基因的克隆、序列测定和分子系统学分析
《蚕业科学 》 2004 北大核心 CSCD
摘要：利用兼并性引物克隆出蓖麻蚕线粒体cox2基因、tRNA Leu基因和cox1基因的部分片段。cox2基因编码框包含 6 85个核苷酸 ,编码 2 2 8个氨基酸的蛋白质 ;起始密码子为ATG ,终止密码子仅有 1个T组成 ;蓖麻蚕mtDNA的cox2基因中富含AT ,含量为 75 77% ,GC的含量为 2 4 2 3%。通过同源性比较 ,发现蓖麻蚕的cox2与柞蚕cox2同源性最高 ,核苷酸和氨基酸序列同源性分别是 89 0 %和 96 0 %。根据cox2氨基酸序列进行了 12种昆虫的分子系统学分析探讨。
关键词： 线粒体DNA 蓖麻蚕 cox2基因 基因克隆 序列测定 聚类分析
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