安徽省克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区序列分析

陈红莲; 王永杰; 蒋业林; 程云生; 张静; 王芬; 《安徽农业大学学报 》 2017 北大核心 CSCD

摘要：白斑综合征已给安徽省克氏原螯虾产业带来了巨大的经济损失。为了解安徽省白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)分子流行病学,2016年4—8月在安徽省6个市采集9个养殖的克氏原螯虾样本进行WSSV套式PCR检测,扩增病毒可变区ORF94、ORF75和ORF125,将获得序列进行比较分析。结果显示,9个样本均在第1轮PCR扩增中获得阳性结果,其ORF94的重复单元(repeat unit,RU)数量为2、4、7、8和12,2RUs为常见基因型,ORF75的组合RUs总数为3、6、9、10和11,9 RUs为常见基因型,排列顺序为45、102、45、102、3×45、102和45,ORF125的RUs为5~9,其中7 RUs和6 RUs为常见基因型。

关键词： 克氏原螯虾 白斑综合征病毒 ORF94 ORF75 ORF125 序列分析