科研产出
安徽地区主栽粳(糯)稻品种遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
《生物学杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：以安徽省近年来主栽的21份粳（糯）稻品种为材料，采用国家标准NY/T 1433—2014中推荐的48对SSR引物进行多态性分析，研究品种间的遗传多样性。48对引物中21个SSR标记在21份材料中存在多态性，共检测到59个等位基因，平均每个标记检测到2.81个。遗传多样性分析显示：Shannon’s多样性指数变幅为0.199～1.163,平均值为0.657;Nei’s指数变幅为0.095～0.620,平均值为0.390。多态信息含量（PIC）处于0.091～0.549,平均值为0.331。21个品种间存在一定遗传差异，但等位基因观测数、Shannon’s指数、Nei’s指数均较低，表明21个品种间遗传背景较为狭窄。UPGMA聚类分析表明：21个粳（糯）稻品种的遗传相似系数为0.426～0.954,遗传相似系数在0.62处可将21个品种分为5个类群。根据标记的PIC值和MI值进一步简化标记的使用量，利用7个核心SSR标记构建了21份粳（糯）稻材料的标准指纹图谱，为品种真实性判别、纯度鉴定以及核心种质提纯奠定基础。
关键词： 粳(糯)稻 遗传多样性 SSR标记 DNA指纹图谱
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安徽省各茶区茶树品系遗传多样性分析及指纹图谱构建
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了解安徽省参加品比试验的各茶区茶树品系的遗传多样性,选取50对SSR引物对安徽省各茶区68份茶树品系进行分析,共检测出650个等位基因,平均每对引物的等位基因数为13个,50对引物扩增的片段长度在95~370 bp,有效等位基因(Ne)值为1.05~17.22,平均为6.10;观测杂合度(Ho)值为0.00~0.99,平均为0.38;期望杂合度(He)值为0~1,平均为0.62;各引物的Shannon信息指数(I)值为0.12~3.06,平均为1.86;多态信息含量(PIC)值变化范围在0.04~0.94,平均为0.72;基因流(Nm)值为0.11~4.45,平均为1.03.选出8对核心引物组合,构建DNA指纹图谱.聚类结果表明,68份茶树品系的居群可聚成3类,与居群的地理分布有一定的相似性,地理距离越近的品系,遗传一致度越大.利用SSR分子标记技术可以为安徽省茶树良种的改良和保护提供参考.
关键词： 茶树品系 SSR分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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