科研产出
长毛兔粗、细毛毛囊转录组比较分析
《中国农业大学学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为筛选出影响兔毛纤维直径的相关基因及调控通路，本研究采用RNA测序（RNA-seq）鉴定长毛兔粗、细毛毛囊中差异表达的基因，并进行差异基因（DEGs）功能富集分析。通过Cytoscape构建蛋白互作网络，筛选出核心基因，最后采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对差异表达基因进行验证。结果表明：1)RNA-seq共鉴定了412个DEGs，相比粗毛毛囊，160个DEGs在细毛毛囊上调表达，252个DEGs下调表达。2)GO功能富集分析显示，差异基因显著富集到330个条目中，包括蜕皮周期、发周期、毛发周期的调节、超分子纤维等与粗、细毛生长相关的条目；KEGG富集分析表明差异表达基因显著富集在雌激素信号通路、蛋白质消化和吸收、内质网中的蛋白质加工途径、PPAR信号通路、FoxO信号通路和基底细胞癌等与长毛兔粗、细毛生长分化有关的信号通路中。3）蛋白互作网络分析表明SHH、LGR5、CTSB、ACTA2和CRNN等是调控毛纤维结构的重要功能基因。综上，本研究鉴定了调控兔毛直径的差异表达基因，挖掘出5个与长毛兔粗、细毛分化相关的候选基因，为细毛型长毛兔的选育提供理论依据和数据支撑。
全文链接
请求原文
薏苡ClVQ12 的表达模式、抗旱功能及互作蛋白分析
2025
摘要：目的薏苡（
关键词：
薏苡
全文链接
请求原文
薏苡ClVQ12的表达模式、抗旱功能及互作蛋白分析
《江西农业大学学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】薏苡（Coix lacryma-jobi L.）是重要的食药同源作物，干旱和土壤盐碱化对薏苡的产量与品质造成严重威胁，VQ基因家族在植物响应外界胁迫与激素诱导中发挥重要作用，克隆薏苡VQ基因家族成员ClVQ12，并分析其表达模式、抗旱能力及互作蛋白，进一步探究VQ基因在薏苡生长发育和胁迫响应过程中所发挥的功能。【方法】以“皖薏2号”为材料，首先克隆ClVQ12和对其进行生物信息学分析；接着通过亚细胞定位试验确定其位置，使用qRT-PCR分析其在MEJA和ABA诱导、高温胁迫、盐胁迫和干旱胁迫下的表达模式，然后构建ClVQ12基因酵母表达载体并转入酵母，比较转基因酵母和对照酵母在干旱胁迫下的生长差异；并利用酵母双杂试验验证ClVQ12与ClVQs和ClWRKYs之间的相互作用。【结果】成功克隆ClVQ12，该基因开放阅读框长度为579 bp；编码192个氨基酸；等电点为5.06；平均亲水性系数为-0.52，是不稳定的亲水性蛋白；该基因定位于细胞膜和细胞核中；不含有跨膜结构域和信号肽，含有18个磷酸化位点。二级结构主要由不规则卷曲（61.46%）、α-螺旋（32.29%）、延长链（4.17%）和β-折叠（2.08%）组成。启动子顺式作用元件分析发现ClVQ12含有多个响应激素诱导和非生物胁迫的元件。表达模式分析表明，该基因受到MEJA、ABA处理和干旱胁迫的显著诱导，其表达量在高温胁迫和盐胁迫下被显著抑制。与pYES2空载酵母相比，ClVQ12转基因酵母在甘露醇模拟干旱胁迫下具有更高的存活率，生长状况更好。通过酵母双杂试验发现，ClVQ12与ClVQ4、ClVQ11、ClVQ26和ClWRKY51发生相互作用，与ClWRKY5不发生相互作用。【结论】ClVQ12基因具有典型的VQ基因家族特征，定位于细胞膜和细胞核，响应多个激素处理和非生物胁迫。ClVQ12与ClVQs和ClWRKY51发生相互作用，提高转基因酵母的耐旱性。
关键词： 薏苡 ClVQ12 VQ基因家族 生物信息学分析 抗旱验证 蛋白互作
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
