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长毛兔粗、细毛毛囊转录组比较分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王源朗 1 ; 丁海生 1 ; 齐平平 1 ; 赵辉玲 1 ; 黄冬维 1 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院畜牧兽医研究所/畜禽产品安全工程安徽省重点实验室

关键词： 长毛兔;毛囊;纤维直径;RNA-seq;蛋白互作

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2025 年 30 卷 001 期

页码： 142-152

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选出影响兔毛纤维直径的相关基因及调控通路，本研究采用RNA测序（RNA-seq）鉴定长毛兔粗、细毛毛囊中差异表达的基因，并进行差异基因（DEGs）功能富集分析。通过Cytoscape构建蛋白互作网络，筛选出核心基因，最后采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对差异表达基因进行验证。结果表明：1)RNA-seq共鉴定了412个DEGs，相比粗毛毛囊，160个DEGs在细毛毛囊上调表达，252个DEGs下调表达。2)GO功能富集分析显示，差异基因显著富集到330个条目中，包括蜕皮周期、发周期、毛发周期的调节、超分子纤维等与粗、细毛生长相关的条目；KEGG富集分析表明差异表达基因显著富集在雌激素信号通路、蛋白质消化和吸收、内质网中的蛋白质加工途径、PPAR信号通路、FoxO信号通路和基底细胞癌等与长毛兔粗、细毛生长分化有关的信号通路中。3）蛋白互作网络分析表明SHH、LGR5、CTSB、ACTA2和CRNN等是调控毛纤维结构的重要功能基因。综上，本研究鉴定了调控兔毛直径的差异表达基因，挖掘出5个与长毛兔粗、细毛分化相关的候选基因，为细毛型长毛兔的选育提供理论依据和数据支撑。

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