科研产出
滁州鲫(Carassius auratus)线粒体全基因组序列分析及系统进化
《渔业科学进展 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为探讨天然三倍体滁州鲫的系统进化地位,采用直接测序法获得滁州鲫线粒体基因组。其序列全长为16581 bp,碱基组成为31.6%A、26.2%T、16.1%G和26.1%C,包括13个蛋白质基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因和1个非编码区,各基因的位置及组成与已公布的鲤科鱼类一致。除t RNA-Ser(AGY)外,其他21个t RNA的二级结构均具有典型的三叶草结构;13个蛋白编码基因中,除COⅠ起始密码子为GTG外,其余均以ATG为起始密码子;COⅡ、ND3、ND4和Cytb基因的终止密码子为不完整的T,其他9个基因均具有完整的终止密码子TAA或TAG。序列分析表明,滁州鲫与其他鲫属鱼类(方正银鲫A系和D系、鲫、淇河鲫、萍乡肉红鲫、黑鲫、日本白鲫和日本银鲫)在线粒体基因组上均具有较高的序列同源性(>94%)。以鲤(Cyprinus carpio haematopterus)为外类群,基于线粒体13个蛋白质基因的核苷酸与氨基酸序列构建上述鲫属鱼类的系统进化树,结果显示,滁州鲫与方正银鲫亲缘关系最近,与黑鲫最远。综合以上研究结果,认为滁州鲫应为银鲫亚种的一个地方种群。
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滁州鲫线粒体细胞色素b基因和控制区序列比较及其系统进化分析
《南方水产科学 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：采用PCR产物直接测序法测定了14尾滁州鲫(Carassius auratus gibelio in Chuzhou)的线粒体细胞色素b(Cytochrome b,Cyt b)基因和控制区(D-loop)全序列,长度分别为1 141 bp和924 bp,且均无核苷酸变异位点。Cyt b基因的T、C、A和G含量分别为29.2%、27.8%、28.5%和14.5%;D-loop的T、C、A和G含量分别为33.2%、20.1%、32.6%和14.1%。2种序列中A+T含量(57.7%,65.8%)均明显大于G+C含量(42.3%,34.2%),且G含量偏低,显示了与其他水生动物线粒体核苷酸碱基含量相似的特征。通过对滁州鲫的控制区结构进行分析,识别了其终止序列区(ETAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的关键序列。滁州鲫与其他鲫属鱼类的Cyt b和D-loop序列均具有高度的相似性,分别为93%~100%和94%~99%。基于2种序列的分子系统进化树分析均表明,滁州鲫与方正鲫(C.auratus gibelio in Fangzheng)亲缘关系最近,而与来自日本的鲫类群亲缘关系最远。
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滁州鲫种质资源现状与选育技术探讨
《浙江海洋学院学报(自然科学版) 》 2012
摘要：滁州鲫产于安徽省滁州市,是我国七大天然雌核发育的鲫鱼种群之一。该鱼生长速度快、个体大、耐低氧、不易染病,更因其肉质细嫩,味甘香醇,一直深受养殖户与当地居民的欢迎,具有巨大的选育和推广应用价值。本文概述了滁州鲫在形态特征、生活习性、养殖技术、养殖性能、遗传特征等方面的研究进展。同时,作者利用滁州鲫种群克隆的多样性和其具有两性生殖、雌核发育的能力,应用现代分子生物学和传统生物学相结合的方法,为滁州鲫的选育提供了新的思路和技术路线。本文丰富了滁州鲫生理生化资料,为科学化选育和饲养滁州鲫提供依据。
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