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滁州鲫(Carassius auratus)线粒体全基因组序列分析及系统进化

文献类型： 中文期刊

作者： 胡玉婷 1 ; 胡王 1 ; 江河 1 ; 凌俊 1 ; 段国庆 1 ; 潘庭双 1 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院水产研究所

关键词： 滁州鲫;线粒体基因组;系统进化分析

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2015 年 36 卷 05 期

页码： 63-70

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨天然三倍体滁州鲫的系统进化地位,采用直接测序法获得滁州鲫线粒体基因组。其序列全长为16581 bp,碱基组成为31.6%A、26.2%T、16.1%G和26.1%C,包括13个蛋白质基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因和1个非编码区,各基因的位置及组成与已公布的鲤科鱼类一致。除t RNA-Ser(AGY)外,其他21个t RNA的二级结构均具有典型的三叶草结构;13个蛋白编码基因中,除COⅠ起始密码子为GTG外,其余均以ATG为起始密码子;COⅡ、ND3、ND4和Cytb基因的终止密码子为不完整的T,其他9个基因均具有完整的终止密码子TAA或TAG。序列分析表明,滁州鲫与其他鲫属鱼类(方正银鲫A系和D系、鲫、淇河鲫、萍乡肉红鲫、黑鲫、日本白鲫和日本银鲫)在线粒体基因组上均具有较高的序列同源性(>94%)。以鲤(Cyprinus carpio haematopterus)为外类群,基于线粒体13个蛋白质基因的核苷酸与氨基酸序列构建上述鲫属鱼类的系统进化树,结果显示,滁州鲫与方正银鲫亲缘关系最近,与黑鲫最远。综合以上研究结果,认为滁州鲫应为银鲫亚种的一个地方种群。

  • 相关文献

[1]滁州鲫线粒体细胞色素b基因和控制区序列比较及其系统进化分析. 胡玉婷,胡王,凌俊,江河,段国庆,潘庭双. 2015

[2]滁州鲫种质资源现状与选育技术探讨. 吴明林,李海洋,侯冠军,何吉祥. 2012

[3]滁州鲫种质资源现状与选育技术探讨. Wu Minglin,吴明林,Li Haiyang. 2012

[4]强壮粗体虫的线粒体基因组及棘头虫的系统发育研究. 潘庭双,聂品. 2014

[5]须鳗虾虎鱼线粒体全基因组测序和系统发育分析. 梁阳阳,张国庆,陈诚,赵秀侠,高娜,李静,方婷,杨坤,尹峰,郭伟,卢文轩. 2023

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