渗透胁迫下水稻根系核仁小分子RNA转录本变化的全基因组表达分析

马廷臣; 陈荣军; 余蓉蓉; 曾汉来; 张端品; 《中国水稻科学 》 2012 北大核心 CSCD

摘要：利用Affymetrix水稻60k芯片研究了聚乙二醇6000(PEG)模拟干旱时,水稻根系核仁小分子RNA(snoRNA)转录本的表达活性变化。在模拟干旱胁迫下,水稻根系snoRNA转录本表达有很强的品种特异性,干旱敏感品种爱华5号中共有23个snoRNA转录本活性发生变化且均表现为上调表达,而耐旱品种湘丰早119中仅有2个snoRNA转录本表达活性发生变化,也都为上调表达;转录活性发生变化的snoRNA转录本都为C/D框型,且在染色体上存在5处snoRNA簇;爱华5号和湘丰早119在模拟干旱胁迫下表达发生变化的snoRNA转录本有1个转录本重叠,且此转录本在爱华5号中表达活性是湘丰早119中的17.54倍。

关键词： 基因芯片 水稻 根系 核仁小分子RNA 转录本 干旱胁迫