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渗透胁迫下水稻根系核仁小分子RNA转录本变化的全基因组表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 马廷臣 1 ; 陈荣军 2 ; 余蓉蓉 1 ; 曾汉来 3 ; 张端品 3 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院水稻研究所/安徽省水稻遗传育种重点实验室/国家水稻改良中心合肥分中心

2.四川农业大学水稻研究所

3.华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室

关键词： 基因芯片;水稻;根系;核仁小分子RNA;转录本;干旱胁迫

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2012 年 26 卷 01 期

页码： 16-20

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用Affymetrix水稻60k芯片研究了聚乙二醇6000(PEG)模拟干旱时,水稻根系核仁小分子RNA(snoRNA)转录本的表达活性变化。在模拟干旱胁迫下,水稻根系snoRNA转录本表达有很强的品种特异性,干旱敏感品种爱华5号中共有23个snoRNA转录本活性发生变化且均表现为上调表达,而耐旱品种湘丰早119中仅有2个snoRNA转录本表达活性发生变化,也都为上调表达;转录活性发生变化的snoRNA转录本都为C/D框型,且在染色体上存在5处snoRNA簇;爱华5号和湘丰早119在模拟干旱胁迫下表达发生变化的snoRNA转录本有1个转录本重叠,且此转录本在爱华5号中表达活性是湘丰早119中的17.54倍。

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