科研产出
1株新型鹅星状病毒的全基因序列分析
《安徽农业科学 》 2024
摘要：为研究新型鹅星状病毒(Novel goose astroviruses, N-GAstV)的遗传进化特征，获得了鹅星状病毒安徽分离株AstV/AHHX的全长基因，为7 251 nt。测序分析显示：AstV/AHHX具有典型的新型鹅星状病毒基因组特征。AstV/AHHX与分离株GDZJ37以及山东分离株G538和G576的遗传距离较近；同时与毒株GDZJ37、G538和G576的ORF2氨基酸序列同源性达100%,ORF1a和ORF1b的同源性也有99.6%以上，推测它们由同一毒株演化而来。ORF2氨基酸序列位点分析显示有12高变异位点，分别是第36(Y/S/H)、60(V/I)、224(T/A)、228(A/S/T)、229(P/Q)、289(T/A)、376(T/A)、456(D/E)、540(Q/L)、608(S/T)、610(E/D/G)、614(N/A/T)位氨基酸。其中第224、228、229、608、614位的氨基酸突变可能导致病毒蛋白质的构象及功能发生变化，进而改变病毒的致病能力。
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安徽省5株新型鹅星状病毒的分离鉴定与遗传进化分析
《浙江农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为研究近年来引起雏鹅痛风病的新型鹅星状病毒流行毒株的病原学和遗传学特征，于2018—2021年从安徽省疑似感染新型鹅星状病毒的雏鹅中采集病料，使用健康鹅胚进行病毒分离，并对分离到的毒株进行全基因组测序和序列分析。结果表明，共分离鉴定到5例新型鹅星状病毒感染样品，利用鹅胚盲传3代成功分离到5株新型鹅星状病毒，均可在鹅胚上稳定传代，分别将其命名为AHAU2018、DY-19、ZY02、HR2105/2和HR2110/1株。全基因组测序结果表明，5株分离毒株的基因组全长均为7 175 nt。系统进化树分析结果表明，5株分离毒株均属于致雏鹅痛风的新型鹅星状病毒，但2019年前的毒株与2019年后的毒株处于不同的进化亚分支上。新型鹅星状病毒在我国已发生变异，出现了新的进化亚分支，但优势基因型是否发生变化还有待进一步研究。
关键词： 新型鹅星状病毒 分离鉴定 全基因测序 遗传进化分析
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