科研产出
基于RNA-Seq技术对不同品种猪排卵前卵泡差异表达基因的筛选与注释
《安徽农业科学 》 2024
摘要：[目的]筛选淮猪和大约克猪排卵前卵泡组织差异表达基因。[方法]采集淮猪和大约克猪各3头的排卵前卵泡，提取RNA,个体独立建库。采用RNA测序技术以及GO和pathway方法对所获序列进行显著性富集分析。[结果]测序后，获得的淮猪clean reads数分别为85 958 912、91 701 082、84 448 828,其中有效Reads数分别达到98.39%、98.59%、96.04%;获得的大约克猪clean reads数分别为87 914 166、80 480 542、85 994 612,其中有效reads数分别达到98.61%、96.95%、98.80%,测序饱和度良好（证明测序数据真实可靠）。结果表明，筛选到上调基因67个，下调基因54个。GO和Pathway分析发现，差异表达基因富集在繁殖过程、生长过程和代谢过程及WNT信号通路、卵巢类固醇生成通路和类固醇生物合成通路等。[结论]获得了猪排卵前卵泡基因表达谱，并筛选到与繁殖性状相关的关键候选基因。
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基于RNA-seq技术对不同品种猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：【目的】筛选皖南花猪和大约克猪背最长肌组织差异表达基因。【方法】采集皖南花猪和大约克猪背最长肌(各3头),测定其肉质性状指标,并提取其RNA,采用高通量转录组测序(RNA-seq)技术进行测序,对所获序列进行GO和Pathway显著性富集分析。【结果】测序后皖南花猪3个样本得到的总序列数分别为65 584 126,64 327 738和59 244 502,其中有效序列达到94.4%,94.3%和94.2%;大约克猪3个样本得到的总序列数分别为57 969 134,68 254 168和72 298 142,其中有效序列达到93.8%,93.7%和93.8%。测序饱和度良好,证明测序数据真实可靠。差异表达分析结果显示,共筛选到347个差异表达基因,其中包含94个上调基因,253个下调基因。GO功能显著性富集和Pathway显著性富集分析发现,差异表达基因富集在与糖酵解代谢和肌肉发育相关的生物学过程中以及与脂肪酸代谢和生长性状、胴体性状相关的信号通路上。【结论】获得了猪背最长肌组织基因表达谱,筛选出了一些与肉质性状和生长性状有关的候选基因。
关键词： RNA-seq 皖南花猪 大约克猪 差异表达基因 背最长肌
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皖南花猪与大约克猪胴体及肉质性状比较研究
《养猪 》 2015
摘要：为了比较皖南花猪和大约克猪的胴体性状和肌肉品质,试验选取皖南花猪和大约克猪各10头,屠宰后对胴体性状、背最长肌的部分肉质性状和16种氨基酸的含量进行测定。结果表明:在胴体性能方面,皖南花猪的屠宰率、腿臀率、眼肌面积分别低于大约克猪0.91个百分点(P<0.05)、6.62个百分点(P<0.01)、26.2 cm2(P<0.01)。皖南花猪的皮厚、背膘厚分别高于大约克猪5.44 mm(P<0.01)、16.54 mm(P<0.01)。在肉质性状方面,皖南花猪的失水率、水分含量、L、a、b分别低于大约克猪7.32个百分点(P<0.01)、0.24个百分点(P<0.05)、5.43(P<0.05)、1.52(P<0.05)、0.13(P<0.05)。皖南花猪的肌内脂肪高于大约克猪1.51个百分点(P<0.01)。皖南花猪的p H2显著高于大约克猪0.28(P<0.01)。在氨基酸含量方面,皖南花猪的氨基酸总量、鲜味氨基酸含量、必需氨基酸含量以及非必需氨基酸含量均显著低于大约克猪(P<0.05),鲜味氨基酸占氨基酸总量的比值显著高于大约克猪(P<0.05)。结论:大约克猪在屠宰性能方面优于皖南花猪,皖南花猪在肉质性状方面优于大约克猪。
关键词： 皖南花猪 大约克猪 胴体性状 肌肉品质 氨基酸含量
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圩猪与大约克猪的肌肉品质比较
《养猪 》 2015
摘要：为比较圩猪和大约克猪的肌肉品质,选取圩猪和大约克猪各10头,屠宰后取背最长肌,按照肉质性状测定标准对部分肉质性状和16种氨基酸含量进行测定。结果表明,肉色,圩猪比大约克猪高12.86%(P<0.05);粗蛋白质,圩猪比大约克猪低6.34%(P<0.05);大理石纹和肌内脂肪含量,圩猪比大约克猪分别高84%(P<0.01)和150%(P<0.01)。背最长肌谷氨酸含量、氨基酸总量、必需氨基酸含量和鲜味氨基酸含量,圩猪比大约克猪分别高11.08%(P<0.01)、5.51%(P<0.01)、4.67%(P<0.01)和7.54%(P<0.01);脯氨酸、亮氨酸和赖氨酸含量,圩猪比大约克猪分别高9.33%(P<0.05)、5.14%(P<0.05)和3.06%(P<0.05);其他指标各组间差异不显著(P>0.05)。说明圩猪具有较好的肌肉品质。
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皖南黑猪和大约克猪胴体及肉质性状比较研究
《养猪 》 2015
摘要：为了比较皖南黑猪和大约克猪的胴体性能和肌肉品质,试验选取皖南黑猪和大约克猪各10头,屠宰后对胴体性能、背最长肌的部分肉质性状和16种氨基酸的含量进行测定。结果表明:胴体性能,皖南黑猪的屠宰率、腿臀率、眼肌面积分别低于大约克猪3.67个百分点(P<0.05)、9.26个百分点(P<0.01)、26.2 cm2(P<0.01)。皖南黑猪的皮厚、背膘厚分别高于大约克猪0.74 mm(P<0.05)、40.42 mm(P<0.01)。肉质性状,皖南黑猪的水分含量极显著低于大约克猪10.14个百分点(P<0.01)。皖南黑猪的p H2、肉色a值、肌内脂肪分别高于大约克猪0.44(P<0.05)、3.37个百分点(P<0.01)、9.21个百分点(P<0.01)。氨基酸含量,鲜味氨基酸占氨基酸总量的比值和必需氨基酸占氨基酸总量的比值皖南黑猪与大约克猪之间差异不显著(P>0.05)。结论:皖南黑猪和大约克猪的胴体性能和肉质性状之间存在较大的差异,在今后的猪育种工作上可以充分利用地方猪种和国外猪种的优点,制定良好的配套体系,培育出优良的猪品种,充分利用好地方猪种的资源优势。
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