草鱼MyoD基因内含子和启动子的克隆与分析

陈静; 樊佳佳; 何吉祥; 黄龙; 宋光同; 吴本丽; 汪翔; 武松; 《基因组学与应用生物学 》 2017 北大核心 CSCD

摘要：本研究采用PCR和染色体步移法克隆了草鱼Myo D基因311 bp的内含子1、125 bp的内含子2及长1 066 bp的部分上游启动子序列。同源性比对分析表明,草鱼Myo D的内含子1与鲤科鱼类的同源性相对较高(87%~97.1%)。生物信息学方法预测草鱼Myo D的启动子序列中发现含有1个核心启动子序列,存在CREB、SP1、ATF等多种与转录诱导调控有关的转录因子结合位点,未发现Cp G岛。草鱼Myo D基因内含子及启动子克隆与特征分析,将为进一步研究鱼类Myo D基因的表达调控及其功能分析提供参考。

关键词： 草鱼 MyoD基因 内含子 启动子 生物信息学