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草鱼MyoD基因内含子和启动子的克隆与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈静 1 ; 樊佳佳 2 ; 何吉祥 2 ; 黄龙 2 ; 宋光同 2 ; 吴本丽 2 ; 汪翔 2 ; 武松 3 ;

作者机构： 1.农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;安徽省农业科学院水产研究所

2.;农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;安徽省农业科学院水产研究所

3.;农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;安徽省农业科学院水产研究所;

关键词： 草鱼;MyoD基因;内含子;启动子;生物信息学

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2017 年 12 期

页码： 5116-5121

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究采用PCR和染色体步移法克隆了草鱼Myo D基因311 bp的内含子1、125 bp的内含子2及长1 066 bp的部分上游启动子序列。同源性比对分析表明,草鱼Myo D的内含子1与鲤科鱼类的同源性相对较高(87%~97.1%)。生物信息学方法预测草鱼Myo D的启动子序列中发现含有1个核心启动子序列,存在CREB、SP1、ATF等多种与转录诱导调控有关的转录因子结合位点,未发现Cp G岛。草鱼Myo D基因内含子及启动子克隆与特征分析,将为进一步研究鱼类Myo D基因的表达调控及其功能分析提供参考。

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