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须鳗虾虎鱼线粒体全基因组测序和系统发育分析

大连海洋大学学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:为了解须鳗虾虎鱼(Taenioides cirratus)线粒体基因组特征和系统发育状况,采用Illumina Hiseq高通量测序技术,测定了从南渡江口、珠江口、太湖、巢湖和南四湖中采集的12尾须鳗虾虎鱼的线粒体全基因组,并下载近缘种线粒体全基因组序列进行系统发育分析。结果表明:须鳗虾虎鱼线粒体全基因组长为16 641~16 978 bp,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个D-loop控制区,各样本的编码基因序列长度较一致,线粒体全基因组长度差异主要是由控制区长度(975~1 314 bp)差异造成的;基于13个蛋白编码基因和2个rRNA基因序列构建系统发育树,须鳗虾虎鱼分为3个高支持率进化枝,与红狼牙虾虎鱼(Odontamblyopus rubicundus)、鲡形鳗虾虎鱼(Taenioides anguillaris)形成并系,太湖、巢湖和南四湖的须鳗虾虎鱼个体聚为1个进化枝,南渡江口和珠江口的须鳗虾虎鱼个体均分属2个进化枝。研究表明,青藏高原隆起和亚洲季风形成带来的中国水系格局变化,可能是须鳗虾虎鱼形成目前系统发育结构的重要原因,本研究结果可为进一步明确须鳗虾虎鱼的分类地位和资源保护提供重要依据。

关键词: 须鳗虾虎鱼 线粒体基因组 系统发育

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农村生活污水贝类净化区细菌群落结构解析

安徽农业科学 2022

摘要:[目的]研究农村生活污水贝类净化区的细菌群落结构.[方法]采用Illumina-MiSeq高通量测序技术对贝类处理单元水体及贝类样品进行细菌多样性分析.[结果]贝类样品中的细菌群落多样性和丰度均显著高于处理单元水体.4组样品中均有大量序列不能被归入已知的属,在门的分类水平上,优势菌门是蓝细菌门(Cyanobacteria)和放线菌门(Actinobacteriota);在属水平上,优势细菌属主要为Cyanobium_PCC_6307、hgc I_clade.菌群分析发现贝类处理单元水体可能处于富营养化进程中.水质检测分析发现贝类通过滤食作用对氨氮、总磷和COD的去除率分别达到39.75%、37.21%、59.52%.[结论]该研究为贝类净水技术提供基础数据,对贝类处理农村生活污水系统的构建具有指导意义.

关键词: 农村生活污水 淡水贝类 净化区 高通量测序 群落结构 细菌多样性

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安徽三座通江湖泊秋季浮游植物群落结构特征及其影响因子

生态学杂志 2021 北大核心 CSCD

摘要:为揭示长江中下游通江湖泊浮游植物群落结构特征及其与水环境因子的关系,于2017年9月(秋季),对安徽3座典型通江湖泊龙感湖、大官湖、黄湖浮游植物种类组成、细胞丰度、生物量等进行调查。结果表明:共检出浮游植物7门50属共107种(包括变种),主要隶属于绿藻门(Chlorophyta)和硅藻门(Bacillariophyta),分别占物种数的50.47%和23.36%;主要优势种为四尾栅藻(Scenedesmus quadricauda)、颗粒直链藻极狭变种(Melosira granulate var.angustissima)、细小平裂藻(Merismopedia minima)、近旋颤藻(Oscillatoria subcontorta)、水华束丝藻(Aphanizomenon flos-aquae);龙感湖中蓝藻门(Cyanophyta)、硅藻门类群优势度较高,大官湖与黄湖优势种以绿藻门、硅藻门与蓝藻门类群为主;通江湖泊秋季浮游植物丰度为2.37×104~44.99×104cells·L-1,生物量为0.017~0.432 mg·L-1,蓝藻门在细胞丰度上占优势,绿藻门与硅藻门在生物量上占优势;3座通江湖泊秋季浮游植物丰度、Shannon指数水平分布差异显著,湖泊连通性、人为活动干扰对群落结构组成具有一定影响。冗余分析表明:影响通江湖泊浮游植物群落结构的主要环境因子不同,龙感湖浮游植物群落结构主要与水深、透明度因素相关;大官湖浮游植物主要受到水深、水温因子影响最大;黄湖浮游植物主要与水体电导率、溶解氧、p H关系密切。

关键词: 浮游植物 群落结构 环境因子 冗余分析 通江湖泊

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中华草龟胚胎发育过程中钙含量的变化

安徽农业科学 2021

摘要:[目的]研究中华草龟胚胎发育过程中钙的来源和代谢规律.[方法]采集了中华草龟受精卵200枚,恒温箱中30℃孵化,检测胚胎发育过程中卵各组分中钙含量的变化.[结果]中华草龟孵化期52~65 d,平均57.2 d.孵化的前25 d胚胎钙含量较低,蛋黄、蛋清和蛋壳内钙含量无明显变化,第30天开始胚胎钙含量迅速增加,蛋清中钙含量迅速减少,直至被吸收殆尽;蛋黄中钙第30~35天不断减少,第40天有所增加,此后不断减少至出壳时吸收殆尽.第40天开始,蛋壳内含物总钙含量显著增加,蛋壳中钙含量降低,表明蛋壳开始成为胚胎发育的主要钙源.整个孵化期,蛋黄、蛋清和蛋壳为胚胎发育分别提供了9.6%、24.9%和65.5%的钙.[结论]蛋壳是中华草龟胚胎发育过程中的主要钙源.该研究是对中华草龟胚胎发育过程中受精卵各组分钙含量变化的首次报道.

关键词: 中华草龟 胚胎发育 孵化 钙代谢

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基于高通量测序研究龟鳖养殖水体细菌多样性

安徽农业科学 2021

摘要:为研究龟鳖养殖水体中微生物资源特征并获取其菌种资源,采用Illumina-MiSeq高通量测序技术对外塘和温室养殖水体及生化流程处理后的尾水进行细菌多样性分析.结果显示,3组样品在门水平上优势菌为变形菌门和拟杆菌门,平均占比分别为55.89% 和14.37%.在属水平上,细菌主要为不动杆菌属,尚未分类的小梨形菌科和红杆菌科.3组水样中均有大量序列不能被归入已知的属,推测其中可能有尚未发现的潜在新种.温室和外塘2种不同养殖模式下,水体理化因子及细菌群落结构组成均存在很大差异.传统微生物分离方法筛选了52株细菌,归属于14种不同的细菌属,其中大部分可作为水产益生菌使用.该研究结果为龟鳖养殖水体的微生态人工调控提供了理论依据.

关键词: 龟鳖养殖 高通量测序 细菌多样性 传统微生物分离

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水稻-乌龟共作模式经济效益分析

安徽农业科学 2021

摘要:为探讨水稻-乌龟共作模式的经济效益,于2018—2019年在芜湖市无为县陡沟镇开展水稻-乌龟共作试验,试验面积1.66 hm2。结果发现,2018—2019年生产成本共286 580元,平均每年生产成本86 319元/hm2;总收入553 300元,除去生产成本,净收入266 720元,平均每年净收益为80 337元/hm2,投入产出比为1∶1.93。水稻仅在移栽初期施肥1次,生长过程中未追肥,未使用农药。由此可见,水稻-乌龟共作模式可以减少化肥和农药的使用,在保证水稻产量的同时,具有较好的经济效益。

关键词: 乌龟 水稻 稻-龟共作 生态养殖

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