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烟草PVY~N辽宁分离物全序列测定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王芳 1 ; 高正良 2 ; 周本国 2 ; 许大凤 2 ; 安梦楠 2 ; 吴元华 2 ;

作者机构： 1.沈阳农业大学植物保护学院

2.沈阳农业大学植物保护学院;安徽省农业科学院烟草所

关键词： 烟草;PVYN-LN;基因组全序列;重组分析

期刊名称： 中国烟草学报

ISSN： 1004-5708

年卷期： 2013 年 04 期

页码： 109-113

收录情况： CSCD

摘要： 利用引起烟草脉坏死病的马铃薯Y病毒脉坏死株系辽宁分离物(Potato virus Y—vein necrosis strain Liaoning isolate,PVYN-LN),以GenBank中已有的PVY全序列为基础,设计特异引物。通过总RNA提取、RT-PCR、3’RACE和5’RACE扩增及序列测定,测得PVYN-LN全长基因组序列(NCBI登录号为JQ971975)包括9714个碱基(含PolyA尾),整条序列仅包含一个由9186个碱基组成的开放读码框(ORF),编码一条包含3061个氨基酸的多聚蛋白。对所得序列进行BLAST,利用MEGA软件对所测得的PVYN-LN全序列与GenBank中已有的PVY全序列及氨基酸进行系统进化分析,发现PVYN-LN分离物与已报道的PVYN株系具有较高的进化亲缘关系,该分离物属于PVYN株系。序列重组分析软件RDP4分析,该序列无重组。

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