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番鸭细小病毒安徽分离株结构蛋白基因的克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 戴银 1 ; 张丹俊 1 ; 赵瑞宏 1 ; 沈学怀 1 ; 胡晓苗 1 ; 侯宏艳 1 ; 潘孝成 1 ; 周学利 1 ;

作者机构: 1.安徽省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 番鸭细小病毒;结构蛋白基因;克隆;序列分析

期刊名称: 动物医学进展

ISSN: 1007-5038

年卷期: 2017 年 38 卷 04 期

页码: 24-27

收录情况: 北大核心

摘要: 为研究番鸭细小病毒(MDPV)安徽分离株的遗传变异特征,通过PCR扩增获得了MDPV结构蛋白(VP)基因全长序列AH-MDPV-VP,并将该序列与GenBank中登录的12条MDPV和鹅细小病毒(GPV)VP基因序列进行比对。结果显示,AH-MDPV-VP基因全长2 199bp,包括完整的VP1、VP2和VP3蛋白编码区。MDPV与GPV的VP基因部分序列一致,但具有明显的差异。进化分析显示,MDPV安徽分离株与基因重组型MDPV上海分离株SAAS-SHNH为同一分支,亲缘关系较近。同源性分析显示二者核苷酸序列同源性最高,为99.9%,且AH-MDPV-VP与GPV毒株SHFX1201的序列同源性也有89.5%。此外安徽分离株与其他MDPV的VP1、VP2和VP3基因同源性有逐步下降的趋势,而与GPV则相反呈上升趋势。进一步显示MDPV安徽分离株与基因重组型MDPV上海分离株SAAS-SHNH相似,可能为MDPV和GPV基因重组型水禽细小病毒。

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