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茶树海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)基因家族鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘丹丹 1 ; 王雷刚 1 ; 孙明慧 1 ; 焦小雨 1 ; 吴琼 1 ; 王文杰 1 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院茶叶研究所

关键词： 茶树;海藻糖-6-磷酸合成酶基因;系统进化;表达模式;非生物胁迫

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2024 年 40 卷 008 期

页码： 152-163

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】海藻糖-6-磷酸合成酶(trehalose-6-phosphate synthase,TPS)是植物体内海藻糖生物合成通路中的关键酶。对茶树[Camellia sinensis(L.)O.Kuntze]TPS基因家族进行鉴定和分析，并研究其在逆境胁迫下的表达模式，为开展TPS基因功能验证提供基础。【方法】利用生物信息学方法鉴定茶树CsTPS基因家族成员，分析其编码的蛋白理化特性、保守基序与结构域、染色体定位、系统进化关系和启动子顺式作用元件等生物学信息，利用转录组数据结合RT-qPCR技术分析CsTPS家族成员在干旱、盐和低温胁迫下的表达模式。【结果】在茶树基因组中鉴定到16个TPS基因家族成员，系统发育分析将它们划分为Class I和Class II两个亚族。同一亚族成员具有相似的motif组成和基因结构。共线性与进化分析表明，CsTPS基因在茶树基因组内发生了基因复制事件，且它们在进化过程中经历了纯化选择作用。RT-qPCR结果显示，6个候选基因CsTPS3、CsTPS5、CsTPS6、CsTPS9、CsTPS11和CsTPS14均被PEG、NaCl和低温胁迫诱导，且表达模式与转录组结果一致。【结论】从茶树全基因组中系统鉴定出16个TPS家族成员。茶树CsTPS3、CsTPS5、CsTPS6、CsTPS9、CsTPS11和CsTPS14基因对干旱、盐和低温胁迫均有响应，但其敏感性水平各不相同。

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