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草鱼MyoD基因SNP和Indel标记的筛选及其与生长性状的关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈静 1 ; 何吉祥 2 ; 樊佳佳 2 ; 黄龙 2 ; 吴本丽 2 ; 宋光同 2 ; 汪翔 2 ; 武松 3 ;

作者机构: 1.安徽省农业科学院水产研究所;农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室

2.;安徽省农业科学院水产研究所;农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室

3.;安徽省农业科学院水产研究所;农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;

关键词: 草鱼;MyoD基因;SNP标记;Indel标记;生长性状

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2018 年 03 期

页码: 612-616

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探索MyoD基因多态性对草鱼(Ctenopharyngodon idella)生长性状的影响,采用PCR产物直接测序的方法,检测草鱼MyoD基因上的突变位点,并分析其与草鱼生长性状的相关性。结果表明:在草鱼MyoD基因上筛选到4个多态性高、分型稳定的突变位点,即M1(940后T碱基的插入)、M3(1630后重复单元AATAGCCT的缺失)、M4(G1669A)和M5(A1681T)。M1位点不同基因型个体间的体长、全长、尾柄长和尾柄高存在显著差异(P<0.05),纯合缺失基因型(DD)显著大于纯合插入基因型(TT);M3和M4位点不同基因型个体间的生长性状差异均不显著(P>0.05);M5位点不同基因型个体间的体质量、体宽、体高和眼间距存在显著差异(P<0.05),优势基因型为TT。MyoD基因的M1和M5突变位点可作为草鱼选育的候选分子标记。

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