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基于线粒体COI序列探讨安徽长江流域黄鳝群体遗传分化

文献类型： 中文期刊

作者： 胡玉婷 1 ; 江河 1 ; 潘庭双 1 ; 凌俊 1 ; 段国庆 1 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院水产研究所

关键词： 黄鳝;COI条形码;遗传分化;长江

期刊名称： 东北农业大学学报

ISSN： 1005-9369

年卷期： 2016 年 47 卷 02 期

页码： 74-80

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 探讨安徽长江流域黄鳝群体遗传结构,采用线粒体COI的DNA条形码序列研究该区6个黄鳝野生群体(当涂、无为、繁昌、贵池、怀宁和望江)遗传分化。180个样本COI片段(665 bp)中共检出52个变异位点(变异率7.8%)、40种单倍型。序列中A、T、G、C碱基平均含量分别为24.7%、28.2%、17.1%、30.0%,A+T含量大于G+C含量。AMOVA分析中,高达68.45%遗传变异来自群体间,说明黄鳝群体间已产生显著遗传分化。群体间系统进化树显示:6个群体形成两大类群(当涂和繁昌群体为一类群,其余群体为另一类群),分析表明结果与各群体地理位置密切相关。同时由NCBI下载合鳃鱼科几个物种的COI同源序列,构建系统进化树,显示黄鳝与同属的山黄鳝聚为一支,并与不同属的合鳃鱼和穴栖蛇胸鳝聚为一支。研究表明,基于COI的DNA条形码序列适于黄鳝群体遗传结构研究。

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