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草鱼呼肠孤病毒AH528株全基因组特征及进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吴明林 1 ; 李海洋 2 ; 江河 2 ; 何吉祥 2 ; 侯冠军 2 ; 蒋阳阳 3 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院水产研究所

2.;安徽省农业科学院水产研究所

3.;安徽省农业科学院水产研究所;

关键词： 草鱼出血病;草鱼呼肠孤病毒;VP1蛋白;水生呼肠孤病毒

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 36-43

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 草鱼出血病是由草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)引起的严重危害1~2龄草鱼的一种传染性疾病。本研究从安徽合肥地区患典型草鱼出血病的病鱼组织中分离到1株新的GCRV致病株,暂命名为GCRV-AH528。鱼体人工感染实验结果显示,实验鱼出现典型的出血病症状:体背发黑,鳍基部、腹部、口腔、鳃丝、肠道充血发红。全基因组特征分析显示,GCRV-AH528由11个双链RNA节段组成,节段大小在1027~3925 bp之间,AT平均含量为50.2%,GC平均含量为49.8%。与其他GCRVⅡ型毒株相比,L1节段在701~702位置缺少3个核苷酸(TAT),少编码1个酪氨基;M4节段出现突变,含2个开放阅读框,编码2个非结构蛋白NS9和NS69。所有节段两端均含有6 bp保守的末端核苷酸序列5'-GUAAU/CU…UU/GCAUC-3';另除L1、M6节段外,其余9个节段均在编码区两侧发现5~9 bp的颠倒互补序列。GCRV-AH528与其他呼肠孤病毒核苷酸平均相似度在37.1%~98.1%之间;编码蛋白平均相似度在24.3%~98.3%之间。基于VP1蛋白的聚类分析结果显示,该病毒属于水生呼肠孤病毒属,在氨基酸水平上与典型株GCRV-873株的进化关系较远。本研究结果表明,该毒株为一株新的草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型致病株。

  • 相关文献

[1]草鱼出血病两种免疫途径的对照试验. 江河,戚少燕,陈宇,李艳和. 2002

[2]特异化饵料免疫预防草鱼出血病的效果. 江河,戚少燕,陈宇,卢文轩,管远亮,李艳和. 2001

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