您好,欢迎访问安徽省农业科学院 机构知识库!

大豆R_(SC4)抗病候选基因Glyma.14G204700的克隆及其生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王大刚 1 ; 陈圣男 1 ; 杨勇 1 ; 李杰坤 1 ; 吴倩 1 ; 胡国玉 1 ; 黄志平 1 ;

作者机构: 1.安徽省农业科学院作物研究所安徽省农作物品质改良重点实验室;福建农林大学海峡联合研究院福建农林大学资源与环境学院

关键词: 大豆;抗病基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称: 植物保护学报

ISSN: 0577-7518

年卷期: 2022 年 04 期

页码: 1013-1021

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确大豆抗大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV)SC4株系的基因位点R_(SC4)(resistance to SMV strain SC4,R_(SC4))的候选基因Glyma.14G204700在大豆不同抗性品种中的序列结构特征和保守结构域,以齐黄1号、科丰1号、大白麻和南农1138-2共4个大豆品种为材料,通过基因克隆获得大豆Glyma.14G204700基因的cDNA全长序列,并采用生物信息学方法分析其序列特征和编码蛋白的理化特性及结构特征。结果表明,大豆Glyma.14G204700基因在4个大豆品种中的cDNA全长为4 719~4 776 bp,编码1 295~1 307个氨基酸,预测蛋白的分子量为148.38~149.33 kD,等电点为5.53~5.61,均为具较强亲水性的非分泌蛋白。Glyma.14G204700蛋白含有植物抗病基因家族蛋白的保守功能域——核苷酸结合域和富含亮氨酸重复结构域。该蛋白的二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-折叠组成,所占比例分别为59.45%~61.08%、28.65%~30.15%、8.11%~8.88%和1.61%~2.16%。启动子序列分析发现该基因含有脱落酸、低温及干旱等多种逆境胁迫响应元件。表明大豆R_(SC4)抗病候选基因Glyma.14G204700在大豆不同抗性品种中具有不同的等位变异,优异等位变异的鉴定和开发可为抗SMV大豆育种提供基础材料。

  • 相关文献

[1]大豆RSC4抗病候选基因Glvma.14G204700的克隆及其生物信息学分析. 王大刚,陈圣男,杨勇,李杰坤,吴倩,胡国玉,黄志平. 2022

[2]193份大豆品系对SMV抗性鉴定与分子标记检测. 王大刚,陈圣男,黄志平,吴倩,胡国玉,李杰坤. 2019

[3]大豆抗大豆花叶病毒病基因研究进展. 王大刚,李凯,智海剑. 2018

[4]不同MHC-DRB1单倍型哈萨克绵羊感染包虫病初期小肠组织差异表达基因筛选与分析. 李鑫,惠文巧,蒋松,贾斌,张永生,申红,李洪涛,王绪海,韩国华. 2015

[5]稻纵卷叶螟几丁质合成酶及合成通路相关酶基因的鉴定及表达分析. 余海中,黄克慧,汪婉玲,刘明辉,杨鑫,张彦,徐家萍. 2015

[6]猪IGFBP3基因生物信息学分析. 许金根,胡洪,王重龙,李庆岗. 2021

[7]砀山酥梨果实COMT基因的克隆和表达分析. 程敏,尹梅,邹鹤伟,金青,闫冲冲,林毅,张金云,徐义流,蔡永萍. 2015

[8]砀山酥梨果实F5H表达与石细胞发育的分析. 徐超,方志,杨芳梅,杨君祎,闫冲冲. 2015

[9]大豆硫磷配施的效应研究. 张继榛,郑路,竺伟民,章力干,司友斌,马友华,唐朝辉,孙义祥,王道中,李龙先,何新宏,王安祥,袁世桂,陈仁虎,王永久. 1998

[10]安徽大豆生产中最佳硫水平的研究. 张继榛,马友华,郑路,竺伟民,章力干,司友斌,孙义祥,王道中,许华武. 1998

[11]绵羊Izumo1基因多态性及其与产羔数关联分析. 胡文萍,董新龙,田志龙,汤继顺,刘秋月,王翔宇,狄冉,张效生,张金龙,王金玉,储明星. 2020

[12]小麦Wcor15基因上游调控区克隆及生物信息学分析. 刘方方,殷桂香,佘茂云. 2018

[13]6株猪流行性腹泻病毒N基因的克隆与分析. 潘孝成,沈学怀,赵瑞宏,戴银,胡晓苗,侯宏艳,周学利,张丹俊. 2019

[14]家蚕G蛋白a亚基基因BmGa73B原核表达及其表达条件优化. 汤强,方玲,章玉萍. 2012

[15]大豆花叶病毒致病基因的克隆与序列分析. 王大刚,智海剑,田震,黄志平,吴倩,张磊. 2015

[16]番鸭细小病毒安徽分离株结构蛋白基因的克隆及序列分析. 戴银,张丹俊,赵瑞宏,沈学怀,胡晓苗,侯宏艳,潘孝成,周学利. 2017

[17]家蚕抗菌肽基因Cecropin-D的克隆及其真核表达载体的构建. 章玉萍,范涛,马忠友,代君君,王储言,李瑞雪,吴传华,田善富,肖林珍. 2010

[18]家蚕G蛋白α亚基基因BmGα73B原核表达及其表达条件优化. 汤强,方玲,章玉萍. 2012

[19]鸭Ⅰ型肝炎病毒VP1基因片段的克隆与表达载体的构建. 赵瑞宏,张丹俊,潘孝成,程宝艳,胡晓苗. 2010

[20]花生NBS-LRR类基因P9的克隆与序列分析. 朱晓峰,姜涛,赵西拥,王嵩,汪清,倪皖莉. 2020

作者其他论文 更多>>