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东南亚62个籼型水稻亲本SSR遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 从夕汉 1 ; 施伏芝 1 ; 阮新民 1 ; 张效忠 1 ; 罗志祥 1 ;

作者机构： 1.安徽省农业科学院水稻研究所/安徽省水稻遗传育种重点实验室

关键词： 水稻;功能基因;遗传多样性;SSR标记

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2016 年 30 卷 05 期

页码： 859-868

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨东南亚水稻亲本间的遗传多样性,以东南亚62份籼型水稻亲本为材料,选择29对水稻功能基因标记以及平均分布于12条染色体、多态性较高和条带清晰的72对SSR引物进行遗传多样性和聚类分析。结果表明,32对多态性引物在62份水稻材料中检测到201个等位基因,每个位点等位基因数(Na)变异范围为2~12,平均为6.281;有效等位基因数(Ne)变异范围为1.067~5.399,平均为2.867;多态信息含量(PIC)变异范围为0.061~0.789,平均为0.515;平均Shannon信息指数(I)为1.176,变幅为0.143~1.908;观察杂合度(Ho)为0.977,范围为0.936~1.000;期望杂合度(He)为0.439,范围为0.179~0.937;固定指数(Fis)的范围为0.882~1.000;基因流(Nm)的范围为0~0.0157。聚类分析表明,在遗传相似系数为0.805处,东南亚水稻亲本被分为6大类,同一国家大多数品种聚为一类。相对于普通分子标记,功能基因标记的平均等位基因数不高,其遗传多样性参数也低于普通分子标记,东南亚各国水稻品种间的亲缘关系较近,遗传多样性程度较低。研究结果为水稻育种亲本选配、新种质资源的创制以及杂种优势利用等提供了科学依据。

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