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番茄含糖量不同的两个材料果实转录组初步分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张文昊 1 ; 张辉 1 ; 刘雨婷 1 ; 王艳 2 ; 张迎迎 1 ; 王馨曼 1 ; 王全华 3 ; 朱为民 1 ; 杨学东 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院园艺研究所

2.安徽省农业科学院园艺研究所

3.上海师范大学生命科学学院

关键词: 番茄;含糖量;成熟期;转录组分析

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2024 年 002 期

页码: 281-294

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以高含糖量(8%)和普通含糖量(4.5%)番茄为研究材料,选取绿熟期、转色期、粉红期和红熟期的果实样品,通过转录组测序比较两种材料间的基因表达差异。分析表明,普通番茄与高糖番茄4个时期共有的差异基因有288个,其中下调的有174个,上调的有114个,转色期特有的差异表达基因数量最多。GO分析表明,差异表达基因显著富集在转色期,且富集的GO功能类也最多。KEGG分析表明,转色期富集的差异表达基因及相关通路最多,主要集中在糖、酸代谢等通路。对糖、酸代谢过程关键酶的相关基因进行聚类分析,发现有30个关键差异表达基因。

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