猪IGFBP3基因生物信息学分析

许金根; 胡洪; 王重龙; 李庆岗; 《安徽科技学院学报 》 2021

摘要：目的:对猪胰岛素样生长因子结合蛋白（IGFBP3）基因的结构与功能进行生物信息学分析。方法:用分子生物学软件分析猪IGFBP3基因序列和IGFBP3蛋白的理化性质、二级结构、结构域、信号肽、跨膜结构、磷酸化和糖基化位点,以及不同动物IGFBP3氨基酸序列的同源性和遗传进化。结果:猪IGFBP3基因编码区长882个碱基对（bp）,编码293个氨基酸。猪IGFBP3蛋白分子式为C_{1 359}H_{2 182}N₄₁₈O₄₁₁S₂₄,相对分子质量为31 722.27,理论等电点为8.97,不稳定系数为48.17,脂肪系数为61.06,平均亲水系数为-0.592。IGFBP3蛋白存在1个长27个氨基酸残基的信号肽,但无跨膜结构,二级结构以无规卷曲（65.87%）和α螺旋（20.82%）为主,含1个胰岛素生长因子结合蛋白同源物（IB）结构域和1个甲状腺球蛋白Ⅰ型重复（TY）结构域,有26个磷酸化位点（包括17个丝氨酸位点、5个苏氨酸位点和4个酪氨酸位点）和3个N-糖基化位点。序列同源性方面猪IGFBP3蛋白与水牛、黄牛、山羊、绵羊、猫、狗、小鼠、大鼠、鸡和鸭的氨基酸序列同源性分别为91.2%、90.8%、87.8%、87.8%、87.2%、86.9%、82.3%、81.2%、73.9%和73.3%。系统进化树构建显示,猪IGFBP3蛋白与水牛、黄牛、绵羊和山羊的亲缘关系最近。结论:预测结果为进一步研究猪IGFBP3基因及其编码蛋白的结构和生物学功能提供基础。

关键词： 猪 IGFBP3基因 生物信息学分析 同源性