禽腺病毒血清4型感染LMH细胞的环状RNA表达分析

殷冬冬; 朱梦琪; 兰梦蝶; 朱星星; 尹磊; 沈学怀; 王洁茹; 赵瑞宏; 戴银; 潘孝成; 《华北农学报 》 2025 北大核心 CSCD

摘要：为分析禽腺病毒血清4 型(FAdV-4)感染鸡肝癌细胞(LMH)后环状RNA(circRNA)的表达谱变化,进一步研究circRNA在FAdV-4 感染过程中的调控作用,以FAdV-4 感染的LMH和未感染细胞为对象进行转录组测序,对差异表达circRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,通过实时荧光定量 PCR(qRT-PCR)对随机挑选的5 个circRNA进行验证.结果表明,感染组和未感染组的circRNA分布于绝大多数染色体上,且长度主要集中在300~1 000 bp.差异表达分析筛选出72 个circRNA,32 个circRNA表达水平显著上调,40 个circRNA表达水平下调.GO功能分析,差异circRNA来源基因主要富集在细胞过程、代谢过程、催化活性和核酸结合转录因子活性等进程.KEGG通路分析显示,差异表达circRNA主要富集在Notch信号通路、RNA降解和MAPK信号通路.qRT-PCR结果表明,被验证的 5 个circRNA表达水平与测序结果趋势一致,进一步验证了测序结果的可靠性.本研究对FAdV-4 感染LMH细胞的cir-cRNA表达谱进行分析,并筛选出差异表达的circRNA,为探究circRNA在FAdV-4 感染过程中的功能及宿主与FAdV-4 互作机制提供数据支持.

关键词： 禽腺病毒血清4型 LMH细胞 转录组测序 环状RNA 差异表达