拮抗水稻病原菌假单胞菌AH菌株的鉴定及全基因组序列分析

胡逸群; 沈文杰; 陈晴晴; 张爱芳; 《安徽农业科学 》 2023

摘要：[目的]探究菌株AH的生防潜力和基因组序列信息，以解析其防病机制，挖掘次级代谢产物基因资源。[方法]采用稀释涂布平板法分离水稻的叶际微生物，筛选具有拮抗效果的菌株；根据形态学、16S rDNA和gyrB基因测序和系统发育分析，鉴定其种属；利用平板抑菌试验明确其抑菌谱；大田喷施菌悬液明确其防治效果。继而，利用第二代Illumina与第三代PacBio结合的测序方法对生防菌进行全基因组测序，对测序数据进行基因组组装、基因预测与功能注释、次级代谢产物合成基因簇预测等分析。[结果]AH是一株短杆状恶臭假单胞菌株，对稻瘟病菌、茎点霉菌、水稻纹枯病菌和水稻黄单胞菌具有广谱抗菌活性，且田间施用AH菌液可显著降低水稻白叶枯病和稻瘟病的病害等级。抗生素敏感性测试揭示菌株AH对氨基糖苷类抗生素高度敏感。AH基因组全长为5 889 125 bp,编码5 215个基因，GC含量为63.74%,有19个rRNA、77个tRNA和78个nRNA,antiSMASH预测得到8个次级代谢产物合成基因簇。[结论]AH菌株具有良好生防潜力，深层机制解析可为病害防控提供科学依据。

关键词： 恶臭假单胞AH 生物防治 稻瘟病 水稻白叶枯病