科研产出
茶树醛脱氢酶(ALDH)超家族的鉴定与表达分析
《农业生物技术学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：醛脱氢酶(aldehyde dehydrogenases, ALDHs)在植物非生物胁迫下的醛稳态中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学方法鉴定茶树(Camellia sinensis) ALDH超家族成员，分析其编码的蛋白理化特性、染色体定位、基因结构、启动子顺式作用元件和系统进化关系等生物学信息；利用qRT-PCR技术分析CsALDH超家族成员在干旱、盐和低温胁迫下的表达模式。结果显示，在茶树基因组中鉴定到27个ALDH超家族成员，系统发育分析将其划分为10个家族。同一家族的成员具有相似的基序组成和基因结构。共线性与进化分析表明，CsALDHs基因在茶树基因组内发生基因复制事件，且在进化过程中经历了纯化选择作用。qRT-PCR结果显示，分别有8、10和9个候选CsALDHs基因被PEG、NaCl和低温诱导表达，尤其是CsALDH2B4和CsALDH3H2显著上调表达。本研究为深入研究茶树ALDH基因的功能提供了理论基础。
关键词： 茶树 醛脱氢酶 全基因组鉴定 系统进化 非生物胁迫
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茶树BURP基因家族全基因组鉴定与表达分析
《江苏农业科学 》 2025 北大核心
摘要：茶[Camellia sinensis(L.) Kuntze]因其极高的营养价值和经济重要性而在全球范围内种植。为了研究茶树中BURP的作用，基于茶树全基因组对茶树中BURP基因家族进行筛选和鉴定。通过TBtools查找筛选包含有PF03181结构域的序列，使用生物信息学对其编码的蛋白质进行染色体定位、系统进化关系、蛋白质理化性质和共线性关系等分析。基于转录组数据挑选对胁迫响应较强烈的基因4个，即CsBURP14、CsBURP7、CsBURP10和CsBURP15,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescent quantitative PCR,qPCR)方法检测其在冷、盐和干旱胁迫下的表达情况。利用茶树基因组数据鉴定出17个BURP基因，聚类为3个亚组，其中PG1β-like包含5条，BNM2-like包含8条，RD22-like包含4条。结构域预测发现只有11条基因包含完整的BURP结构域，6条序列只包含其中的1或2个motif,而CsBURP1不包含这3个motif。CsBURP14、CsBURP7、CsBURP10和CsBURP15均响应干旱胁迫、冷胁迫和盐胁迫。CsBURP7响应最剧烈，在低温处理下为负调控，保持在初始表达量的1/3左右，干旱处理则为正调控，12 h时为初始值的6倍。CsBURP家族对低温胁迫、盐胁迫和干旱胁迫均有响应，推测其在茶树抗逆中发挥重要作用。
关键词： BURP基因家族 茶树 基因表达 非生物胁迫 全基因组鉴定
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