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绵羊Izumo1基因多态性及其与产羔数关联分析

中国农业大学学报 2020 北大核心 CSCD

摘要:为研究Izumo1基因多态性及与产羔数关系,本研究利用PCR和直接测序法对小尾寒羊和苏尼特羊的Izumo1基因DNA序列进行扩增、测序和BLAST分析,并和本课题组前期绵羊重测序数据进行比对,筛选出Izumo1基因SNP位点。同时,采用Sequenom MassARRAY~?技术进行基因分型,并对其SNP位点的基因型和等位基因频率在各群体中的分布进行研究。结果表明:小尾寒羊Izumo1基因DNA全长序列3 385 bp,苏尼特羊Izumo1基因DNA全长序列3 382 bp;筛选出8个Izumo1基因SNP位点,经过初步筛选,将在小尾寒羊、苏尼特羊、滩羊、萨福克羊、杜泊羊、草原藏羊这6个绵羊品种中位点分布没有差异的SNP位点排除,最终筛选获得的g.54412135A>G和g.54412107C>A 2个位点。Izumo1基因g.54412135A>G位点在多羔和单羔绵羊品种中存在GG、GA和AA 3种基因型,G基因为优势等位基因;g.54412107C>A在多羔品种中存在CC和CA 2种基因型,而在单羔品种中存在CC、CA和AA 3种基因型,C基因为优势等位基因,其基因型频率和基因频率在单、多羔绵羊群体间的分布差异均极显著(P<0.01);群体遗传学分析得出g.54412135A>G多态位点在6个品种中的多态信息含量(PIC)都属于低度多态(PIC<0.25);g.54412107C>A多态位点在杜泊羊中属于中度多态(0.25G和g.54412107C>A位点的不同基因型与小尾寒羊不同胎次产羔数之间不存在显著关联(P>0.05)。

关键词: 绵羊 Izumo1基因 克隆 多态性 SNP 产羔数

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精卵融合相关基因CD9和CD81在绵羊组织中的表达分析

农业生物技术学报 2018 北大核心 CSCD

摘要:CD9和CD81是哺乳动物精卵融合重要的候选因子,其在机体内组织表达情况尚不清楚。为了初步探讨CD9和CD81基因在绵羊(Ovis aries)组织中的表达情况,本研究利用半定量反转录-聚合酶链式反应(semi-quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,sqRT-PCR)和实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术对两个基因在卵泡期小尾寒羊(高繁殖力)和苏尼特羊(低繁殖力)各组织中的表达进行了比较分析。结果表明,CD9和CD81基因在两种绵羊的14种组织中均有表达;CD9基因表达量在两个品种绵羊输卵管组织中都最高,且在小尾寒羊下丘脑、垂体和卵巢组织中的表达都极显著高于苏尼特羊(P<0.01);在小尾寒羊卵巢和下丘脑组织中的表达显著高于垂体和子宫(P<0.05),在苏尼特羊下丘脑和子宫组织中的表达显著高于卵巢和垂体(P<0.05)。CD81基因在小尾寒羊繁殖轴组织中的表达均极显著高于苏尼特羊(P<0.01);CD81基因表达量在小尾寒羊下丘脑组织中最高(P<0.01),在垂体和输卵管组织中的表达极显著高于卵巢和子宫(P<0.01);CD81基因表达量在苏尼特羊卵巢组织中最高(P<0.01),在下丘脑组织中的表达极显著高于垂体、输卵管和子宫(P<0.01)。研究结果提示CD9和CD81基因可能与绵羊繁殖力有关,为初步揭示绵羊繁殖性能的分子调控机制提供了参考。

关键词: 绵羊 精卵融合 CD9基因 CD81基因 组织表达

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绵羊CD9基因g.208082881C>A位点多态性与产羔数的关联分析

中国草食动物科学 2018

摘要:为了探究绵羊CD9基因g.208082881C>A位点多态性与产羔数之间的关系,利用Sequenom Mass ARRAYR~SNP技术对多羔绵羊品种(小尾寒羊380只)和单羔绵羊品种(滩羊、苏尼特羊、萨福克羊、杜泊羊和草原藏羊共380只)CD9基因g.208082881C>A位点多态性进行了检测,并与产羔数进行关联分析。结果表明:CD9基因g.208082881C>A位点存在AA和CA两种基因型,A基因为优势等位基因,等位基因频率在单羔、多羔绵羊品种间差异达到极显著水平(P<0.01);群体遗传学分析表明,该位点在杜泊羊群体中表现为低度多态(PIC<0.25),而在其他绵羊品种中均为中度多态(0.250.05);关联分析表明,该位点多态性与小尾寒羊不同胎次产羔数之间并无显著关联(P>0.05),AA型第二、三胎产羔数高于CA型。综上可知,CD9基因g.208082881C>A位点多态与小尾寒羊产羔数没有显著相关性。

关键词: 绵羊 CD9基因 SNP分型 产羔数

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